[发明专利]一种太湖水体中浮游细菌群落的评价方法在审
| 申请号： | 201710128594.8 | 申请日： | 2017-03-06 |
| 公开（公告）号： | CN106929578A | 公开（公告）日： | 2017-07-07 |
| 发明（设计）人： | 薛银刚;滕加泉;谢文理;张皓;宗玉婷;王倩 | 申请（专利权）人： | 常州市环境监测中心 |
| 主分类号： | C12Q1/68 | 分类号： | C12Q1/68;C12Q1/04 |
| 代理公司： | 贵阳派腾阳光知识产权代理事务所(普通合伙)52110 | 代理人： | 谷庆红 |
| 地址： | 213001 江苏*** | 国省代码： | 江苏;32 |
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| 摘要： | 本发明提供一种太湖水体中浮游细菌群落的评价方法，包括对太湖流域11个采样点的水样进行微生物基因组DNA提取，对提取的DNA通过普通PCR扩增，实时荧光定量PCR等方法定量分析样品中16S rDNA丰度；对16S rRNA基因PCR扩增后的产物进行纯化，纯化产物采用第二代高通量测序技术进行测序，测序结果经过数据处理分析后用于对水体中浮游细菌种群进行解析。该方法从基因角度揭示蓝藻水华的群落结构及与环境间的互动关系，预测环境变化可能导致群落结构发生变化的情况；采用了第二代高通量测序Miseq平台对太湖水体及底泥中的微生物群落结构进行了测定，更加系统地辅助解析太湖水体中微生物的群落结构与相应丰度。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 太湖 水体 浮游 细菌 群落 评价 方法 | ||
【主权项】：
一种太湖水体中浮游细菌群落的评价方法，其特征在于，包括以下步骤：(1)采集太湖流域共11个采样点的水样；(2)将步骤(1)中的11个水样分别用0.45μm的混合纤维素滤膜过滤并分别收集过滤出的微生物样品，待滤膜完全堵住为止；(3)对步骤(2)中过滤出的11个微生物样品分别进行DNA的提取；(4)对步骤(3)中提取的DNA样品利用超微量蛋白质核酸分析仪测定其浓度和纯度，并将DNA样品保存于‑20℃下；(5)对步骤(4)中的DNA样品进行16S rDNA的普通PCR扩增，以及实时荧光定量PCR定量分析；(6)对步骤(4)中的DNA样品进行16S rRNA基因的PCR扩增，对得到的扩增产物进行纯化，得到PCR纯化产物；(7)对步骤(6)中的PCR纯化产物进行Miseq高通量测序，测序结果进行数据的降噪处理后，在处理平台上进行系统分类，对太湖水体中浮游细菌进行微生物群落解析。
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