[发明专利]一种基因组序列的指纹图谱的景观分析方法及用途

摘要

本发明属于生物信息学技术领域，涉及一种基因组序列的指纹图谱的景观分析方法及用途。本发明的方法是组合构造2种基因组序列的指纹图谱1个基因组序列的指纹图谱（a map of genome fingerprints）和1组（含2个及2个以上的）基因组序列的指纹图谱云图（a galaxy of genome fingerprints maps）。由此全局集中展示批量基因组序列的指纹图谱，比较分析指纹图谱的综合景观的差异。本发明方法的用途包括3个方面辨识基因组序列的不同组装版本的差异，校验基因组序列的组装质量，检测基因组序列中的重复序列。

主权项

一种基因组序列的指纹图谱的景观分析的方法，其特征是组合构造1个基因组序列的指纹图谱（a map of genome fingerprints）；所谓的基因组序列的指纹图谱，其特征在于是一幅组合图，采用专利文献公告CN103106353A公开的技术方法，首先计算1个基因组序列中的每个碱基的三维空间坐标值（xn, yn, zn）（n=1, 2, …, N；N为基因组序列的长度），然后在同一幅组合图中同时绘制1个基因组序列所对应的6个二维平面轨迹曲线图（xn~n），（yn~n），（zn~n），（yn~xn），（zn~yn），（zn~xn）；还可以在同一幅组合图中绘制1个基因组序列所对应的1个三维空间曲线图（xn~yn~zn）。