[发明专利]建立健康人尿蛋白质组定量参考范围的方法及健康人尿蛋白质组数据库有效
| 申请号： | 201710048188.0 | 申请日： | 2017-01-20 |
| 公开（公告）号： | CN108334752B | 公开（公告）日： | 2020-09-04 |
| 发明（设计）人： | 秦钧;甄蓓;冷文川;倪晓天;路天元;王广舜;孙长青;钟博文 | 申请（专利权）人： | 北京松果天目健康管理有限公司 |
| 主分类号： | G16B50/30 | 分类号： | G16B50/30 |
| 代理公司： | 北京尚诚知识产权代理有限公司 11322 | 代理人： | 鲁兵 |
| 地址： | 102206 北京市昌平区科*** | 国省代码： | 北京;11 |
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| 摘要： | 本发明公开了建立健康人尿蛋白质组定量参考范围的方法和健康人尿蛋白质组数据库，是将统计数量健康人的尿样制成尿蛋白样品，经质谱检测、搜库及定量确定其中的蛋白种类及各蛋白的定量形成一个尿蛋白质组数据，将不同尿蛋白质组数据归集不同的尿蛋白质组亚数据集和总数据集，利用数据集的数据计算得到健康人尿蛋白质组定量参考范围。利用本发明建立的健康人尿蛋白组数据库中人尿蛋白的定量参考范围能够更好地排除在尿蛋白生物标志物发现过程中来自生理性波动和个体间差异蛋白的干扰。 | ||
| 搜索关键词： | 建立 健康 蛋白质 定量 参考 范围 方法 数据库 | ||
【主权项】：
1.建立健康人尿蛋白质组定量参考范围的方法，包括以下步骤：1)采样：采集统计数量健康人的尿样；2)制备尿蛋白样品：将采集的每一个尿样制成一个尿蛋白样品；3)检测：对每一个尿蛋白样品进行质谱检测，得到每一个尿蛋白样品的质谱数据；4)搜库及定量：对每一个尿蛋白样品的质谱数据进行数据库搜索、肽段定量及蛋白拼接组装，确定每一个尿蛋白样品中的蛋白种类及各蛋白的定量形成一个尿蛋白质组数据；5)就不同人及不同采样时间跨度确定不同的亚数据集，包括：将单个人不同采样时间跨度的全部尿蛋白样品的尿蛋白质组数据归集得到该人的个体内尿蛋白质组亚数据集；将多人少次或单次采样的的全部尿蛋白样品的尿蛋白质组数据归集得到个体间尿蛋白质组亚数据集；6)计算每一亚数据集内全部尿蛋白定量数据的变异系数的分布范围用以评估个体内生理性波动；7)利用随机重采样的方法，对采样时间跨度最长的2个人的亚数据集进行分析，确定覆盖健康人尿蛋白质组个体内生理性波动或差异所需的采样个数；8)将全部数量人数的亚数据集合并得到健康人尿蛋白质组数据的总数据集；每个亚数据集或总数据集中至少10％的尿样中有定量信息的蛋白才参与评估各亚数据集或总数据集的尿蛋白质组个体间生理性波动和差异的评估；9)利用总数据集的数据计算健康人尿蛋白质组定量参考范围。
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- 一种油菜数字化育种方法-202310166911.0
- 李玉芳;贺璐;肖才升;陈庭舟;杨春安;卜勇;傅淋;陈泽南;戴恺 - 湖南省棉花科学研究所
- 2023-02-09 - 2023-06-06 - G16B50/30
- 本发明提供一种油菜数字化育种方法，涉及油菜育种技术领域，所述油菜数字化育种方法主要包括三个模块，分别为表型数据模块、综合模型模块和基因优化组合模块，包括以下步骤：S1、实验样本的获取与种植；S2、表型数据进行采集；S3、将二维表型图像、三维表型图像上传计算机；S4、建立综合模型模块；S5、建立基因优化组合模块；S6、进行基因的优化组合，选出性状优良的油菜品种。本发明利用无人机搭载多种类型的光学图谱传感器，采集油菜不同生长阶段的表型数据，然后利用超级计算机综合油菜各材料的基因型、表型和环境等因素建立综合模型，最后进行基因优化组合，快速找到最优基因的搭配，精准、高效地筛选出性状优良的油菜品种。
- 批量更新基因组组装和注释文件ID的方法和装置-202211712048.6
- 康玲;周勋;彭珍;赵勇;王龙;陶琳娜;马策 - 北京诺禾致源科技股份有限公司
- 2022-12-29 - 2023-06-06 - G16B50/30
- 本发明提供了一种批量更新基因组组装和注释文件ID的方法和装置。该方法包括：S1，使用mummer软件与已知的近源物种的参考基因组进行比对，将基因组的原ID更新为与参考基因组上染色体顺序及方向顺序一致的新ID；S2，利用预设的基因命名格式对各基因在相应染色体上的位置进行排序，从而获得各基因新ID的注释文件。本申请的方法批量更新方式简单快速、且更新后的ID格式统一，易于后续分析。
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