[发明专利]口腔菌群多样性的分析方法及与疾病相关的菌群标志物在审
申请号: | 201710019638.3 | 申请日: | 2017-01-12 |
公开(公告)号: | CN106636423A | 公开(公告)日: | 2017-05-10 |
发明(设计)人: | 杨俊杰;张磊;姜梦菡 | 申请(专利权)人: | 杨俊杰 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12Q1/04;C12N15/11 |
代理公司: | 北京瑞思知识产权代理事务所(普通合伙)11341 | 代理人: | 李涛 |
地址: | 250014 山东省济南市*** | 国省代码: | 山东;37 |
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摘要: | 本发明提供了一种基于二代高通量测序技术的口腔菌群多样性的分析方法及与疾病相关的菌群标志物。其中,该方法包括如下步骤1)提取待测唾液样本的DNA;2)配置PCR反应体系,进行细菌16S rDNA V1‑V2区的PCR扩增反应;上述PCR反应体系中包含PCR扩增模板、通用引物对等;3)将PCR产物进行目标片段的检测以及PCR产物的纯化;4)将纯化后的PCR产物进行二代高通量测序,检测唾液样本中的微生物的种类;5)利用Ion Torrent PGM测序系统进行测序;6)利用FLASH,QIIME,usearch61进行生物信息学分析。本方法通过二代高通量测序技术,对疾病患者口腔菌群多样性及差异性进行检测,与传统菌群检测方法相比,应用新一代高通量技术能够更详细、更深层地解析菌群的组成与功能。 | ||
搜索关键词: | 口腔 多样性 分析 方法 疾病 相关 标志 | ||
【主权项】:
一种对于检测待测样品中微生物种类的16S rDNA V1‑V2区特异性引物对,其特征在于,所述引物对是能够特异性扩增所有需要检验的微生物来源的引物对。
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