[发明专利]一种与黄牛生长性状相关的MEG3基因SNP的检测方法及其应用

摘要

本发明公开了一种与黄牛生长性状相关的MEG3基因SNP的检测方法及其应用，根据黄牛MEG3基因外显子区单核苷酸突变位点所在位置，采用PCR‑RFLP、Tetra‑primer ARMS‑PCR技术对黄牛个体进行分型，分型结果与生长数据关联分析。本发明提供的检测方法是在DNA水平上检测与黄牛生产性状密切相关的SNP标记，可用于中国黄牛品种生长性状标记辅助选择中，加快建立优良黄牛种群。

主权项

1.一种与黄牛生长性状相关的MEG3基因SNP的检测方法，其特征在于，包括以下步骤：/n以待测黄牛全基因组DNA为模板，以引物对P为引物，PCR扩增黄牛MEG3基因片段，然后利用限制性内切酶AvaI对根据引物对P扩增得到的产物进行酶切，再对酶切后的产物片段进行琼脂糖凝胶电泳，根据凝胶电泳结果鉴定黄牛MEG3基因上单核苷酸多态性位点SNP1的基因型；以待测黄牛全基因组DNA为模板，以内引物对I和外引物对U为引物，PCR扩增黄牛MEG3基因片段，对扩增产物进行琼脂糖凝胶电泳，根据凝胶电泳结果鉴定黄牛MEG3基因上单核苷酸多态性位点SNP2的基因型；所述单核苷酸多态性位点SNP1的凝胶电泳结果为：CC基因型表现为218bp条带，CT基因型表现为218bp、147bp和71bp条带，TT基因型表现为147bp和71bp条带；所述单核苷酸多态性位点SNP2的凝胶电泳结果为：GG基因型表现为237bp和161bp条带，GT基因型表现为237bp、161bp和132bp条带，TT基因型表现为237bp和132bp条带；/n在夏南牛中，SNP2与体斜长和管围呈显著相关，基因型GG为提高夏南牛体斜长和管围的候选分子遗传标记；在皮南牛中，SNP1与十字部高、腰角宽显著相关，基因型TT为提高皮南牛十字部高和腰角宽的候选分子遗传标记，SNP2与体斜长和尻长呈极显著相关，与胸围呈显著相关，基因型GT为提高皮南牛体斜长、尻长和胸围的候选分子遗传标记；在秦川牛中，胸围与SNP1和SNP2呈显著相关，胸深与SNP2显著相关，杂合型TC和GT为提高秦川牛胸深和胸围的候选分子遗传标记；/n所述的引物对P为：/n上游引物F1：5’-CGTCCTTCTAACGTTCTGCCTGT-3’/n下游引物R1：5’-GCCTGATGAAATCGTGGTGTCTC-3’；/n所述的内引物对I为：/n上游引物F2：5’-AAGGAGGACTATGTCAGGTTATTATGAG-3’/n下游引物R2：5’-CGTATTTGGATTAATCCTAATGCTTAGA-3’；/n所述的外引物对U为：/n上游引物F3：5’-AAAATGGAAAGATGCAAATTAATATGTAA-3’/n下游引物R3：5’-GTTAAAGTTAAATCTCATCTCTGGTTCC-3’。/n