[发明专利]一种鉴定印度南瓜×中国南瓜杂交种砧木品种真实性方法有效

专利信息
申请号: 201610837480.6 申请日: 2016-09-09
公开(公告)号: CN107805672B 公开(公告)日: 2021-03-12
发明(设计)人: 宋慧;张香琴;王迎儿;黄芸萍 申请(专利权)人: 宁波市农业科学研究院
主分类号: C12Q1/6895 分类号: C12Q1/6895
代理公司: 北京慕达星云知识产权代理事务所(特殊普通合伙) 11465 代理人: 李冉
地址: 315040 浙*** 国省代码: 浙江;33
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摘要: 发明题为《一种鉴定印度南瓜×中国南瓜杂交种砧木品种真实性方法》,属于生物领域。鉴别品种真实性对维护生产者和育种者的利益日益重要。印中杂交南瓜砧木品种繁多外观相似,利用形态指标甄别真伪,耗时长可靠性差,为此,发明一种利用分子标记鉴定品种真实性的方法成为当务之急。技术方案为利用5对SSR引物(SEQ ID NO.1‑SEQ ID NO.10)对三个砧木品种及对照材料进行PCR扩增,产生的9个差异位点经过“1”和“0”赋值,构建品种指纹图谱用以真实性鉴定。发明以更灵敏的鉴定手段、更低的时间人工成本,对印中杂交南瓜砧木品种‘甬砧7号’、‘甬砧8号’和‘甬砧10号’进行更准确更有效的鉴定与保护。
搜索关键词: 一种 鉴定 印度 南瓜 中国 杂交种 砧木 品种 真实性 方法
【主权项】:
一种鉴定印度南瓜×中国南瓜杂交种砧木品种真实性的方法,包括以下步骤:(1)取样:播种‘甬砧7号’、‘甬砧8号’和‘甬砧10号’及其对照材料,待植株长至5‑6片真叶时,采集嫩叶1g,‑80℃保存;(2)DNA提取:参照CTAB法提取新鲜叶片总基因组DNA;(3)PCR扩增:混样体系为15μl,包括1.5μl dNTP(1.25mM),1.5ul 10×buffer,1.5ul MgCl2(25mM),2.0ul引物(5mM;SSR两条引物分别添加1.0ul),5ul DNA(10ng/ul),0.05ul Taq(1U),3.45ul超纯水。PCR扩增程序为:预变性94℃1min;变性93℃1min,退火40℃1min,延伸72℃2min(40个循环);延伸72℃1min;(4)PCR产物检测:使用2.5%高分辨率标准凝胶琼脂糖(DNA片段分离范围40‑1Kbp)。添加20μl EB(ethidium bromide,溴化乙锭)显色。在PCR产物中加入2μl Loading Dye,电泳2‑3小时,电压200‑250v。电泳结束后,利用凝胶成像系统观察结果;(5)数据收集与分析:对5对SSR引物N11/12、N41/42、N51/52、N121/122和N155/156在‘甬砧7号’、‘甬砧8号’、‘甬砧10号’及对照材料5558、5559、‘明秀’和‘金甲田’的扩增结果进行赋值,某等位基因扩增出条带的记为“1”,同一位点无扩增条带的记为“0”。将这些差异扩增片段转换为由1和0组成的字符串,即构成品种指纹图谱(表1)。利用7个分子标记产生的15个多态性位点,构建‘甬砧7号’的指纹图谱;其中,所述5对SSR引物中N11/12的序列如SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.2所示,N41/42的序列如SEQ ID NO.3和SEQ ID NO.4所示,N51/52的序列如SEQ ID NO.5和SEQ ID NO.6所示,N121/122的序列如SEQ ID NO.7和SEQ ID NO.8所示,N155/156的序列如SEQ ID NO.9和SEQ ID NO.10所示。
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