[发明专利]一种针对目标区域进行DNA甲基化测序的方法有效
申请号: | 201610561805.2 | 申请日: | 2016-07-15 |
公开(公告)号: | CN106191256B | 公开(公告)日: | 2020-01-10 |
发明(设计)人: | 王瑞超;蔡万世;屈武斌;邵谦之;杭兴宜 | 申请(专利权)人: | 艾吉泰康生物科技(北京)有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6869 | 分类号: | C12Q1/6869 |
代理公司: | 11587 北京汇知杰知识产权代理有限公司 | 代理人: | 蔡伦 |
地址: | 102206 北京市昌平区北京市中关*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | 本发明提供了一种针对目标区域进行DNA甲基化测序的方法,所述方法包括:提供包含目标核酸序列的核酸样品和与目标核酸序列一致或对目标序列具有特异性的诱饵序列;以所述诱饵序列为模板进行扩增得到DNA双链池,随后对DNA双链池进行DNA甲基转移酶处理和亚硫酸盐处理,进而通过体外转录制备核酸类似物,所述核酸类似物带有结合部分;对所述核酸样品进行基于亚硫酸盐处理;所述处理的核酸样品与所述核酸类似物杂交,使得所述核酸类似物与所述处理的核酸样品中的目标区域形成核酸类似物/DNA杂交复合物;通过所述结合部分,去除所述处理的核酸样品中的非目标区域的核酸,并对获得的目标区域核酸进行测序。 | ||
搜索关键词: | 一种 针对 目标 区域 进行 dna 甲基化 方法 | ||
【主权项】:
1.一种针对目标区域进行DNA甲基化测序的方法,所述方法包括:/na) 提供包含目标区域的核酸样品和与目标区域一致或对目标区域具有特异性的诱饵序列,其中对每个目标区域,所述诱饵序列是在特异性、二聚体、发卡结构以及与目标区域的相对位置方面综合评分最优的一个或者多个诱饵序列,所述综合评分通过如下的打分函数进行:S = a×S
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