[发明专利]一种基于基因芯片分析研究大肠杆菌丁醇耐受性关键基因的方法在审

专利信息
申请号: 201610352528.4 申请日: 2016-05-25
公开(公告)号: CN105950731A 公开(公告)日: 2016-09-21
发明(设计)人: 倪晔;韩瑞枝;许国超;董晋军;司海明 申请(专利权)人: 江南大学
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68
代理公司: 暂无信息 代理人: 暂无信息
地址: 214122 江苏*** 国省代码: 江苏;32
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摘要: 发明公开了一种基于基因芯片分析研究大肠杆菌丁醇耐受性关键基因的方法,属于生物工程技术领域。具体涉及采用基因芯片技术分析在丁醇胁迫条件下大肠杆菌E.coli JM109/pHACMB8和对照菌株的基因组转录水平差异,鉴定获得与大肠杆菌丁醇耐受性密切相关的两个基因yibT和yghW,以及与丁醇耐受性相关的主要代谢途径,为进一步阐明微生物菌株的丁醇耐受性机制提供了理论依据。
搜索关键词: 一种 基于 基因芯片 分析研究 大肠杆菌 丁醇 耐受 关键 基因 方法
【主权项】:
采用基因芯片分析在丁醇胁迫条件下大肠杆菌E.coli JM109/pHACMB8和对照菌株的基因组转录水平差异,鉴定与丁醇耐受性相关的基因yibT和yghW,以及相关代谢途径,其特征在于:(1)基因yibT和yghW编码假定蛋白,参与细胞膜不饱和脂肪酸含量的调控,特别是C16:1和C18:1。(2)和对照菌株相比,基因yibT和yghW的敲除菌株的丁醇耐受性显著提高。(3)大肠杆菌E.coli JM109/pHACMB8的丁醇耐受性主要涉及乙醛酸二羧酸,丙酸,丙酮酸,氧化磷酸化,糖和氨基酸代谢途径,以及ABC转运系统。(4)大肠杆菌E.coli JM109/pHACMB8携带σ70突变基因rpoDM2,其编码的氨基酸序列为SEQ ID NO:1。
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