[发明专利]一种利用|Δ(SNP-index)|进行性状定位的QTL-seq方法及其应用有效
| 申请号： | 201610291847.9 | 申请日： | 2016-05-04 |
| 公开（公告）号： | CN105907860B | 公开（公告）日： | 2019-05-24 |
| 发明（设计）人： | 薛华柏;李秀根;侍婷;杨健;王龙;王苏珂;苏艳丽;张慧蓉 | 申请（专利权）人： | 中国农业科学院郑州果树研究所 |
| 主分类号： | C12Q1/6895 | 分类号： | C12Q1/6895 |
| 代理公司： | 北京冠和权律师事务所 11399 | 代理人： | 朱健 |
| 地址： | 450009 河*** | 国省代码： | 河南;41 |
| 权利要求书： | 查看更多 | 说明书： | 查看更多 |
| 摘要： | 一种利用|Δ(SNP‑index)|进行性状定位的QTL‑seq方法及其应用，该方法以参考基因组代替亲本之一的基因组作为参照计算子代池SNP‑index，用Δ(SNP‑index)的绝对值|Δ(SNP‑index)|代替Δ(SNP‑index)用于滑动窗口法性状定位分析，通过对双亲具有相同表型的分离群体的极端表型池进行QTL‑seq分析，并利用|Δ(SNP‑index)|的分布进行目标性状基因或主效QTL的定位预测，改变了常规QTL‑seq方法只能应用于双亲纯合且具有相对性状的分离群体的状况，使QTL‑seq方法能够应用于双亲具有相同性状的分离群体，极大地拓展了QTL‑seq方法的应用范围，具有很好的应用前景。应用该方法对双亲均为红皮东方梨的“满天红”ד红香酥”杂交组合红皮表型池和绿皮表型池进行分析，将东方梨红皮/绿皮性状位点定位在1.86Mb的区间内。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 利用 snp index 进行 性状 定位 qtl seq 方法 及其 应用 | ||
【主权项】：
1.一种利用|Δ(SNP‑index)|进行性状定位的QTL‑seq方法在东方梨红皮/绿皮性状位点定位中的应用，其特征在于：所述利用|Δ(SNP‑index)|进行性状定位的QTL Seq方法以参考基因组代替亲本之一的基因组作为参照计算子代池SNP‑index，将子代池中SNP‑index小于0.3，并且SNP深度小于7的位点予以过滤去除，然后用Δ(SNP‑index)的绝对值|Δ(SNP‑index)|代替Δ(SNP‑index)用于滑动窗口法性状定位分析，通过对双亲具有相同表型的分离群体的极端表型池进行QTL Seq分析，并利用|Δ(SNP‑index)|的分布进行目标性状基因或主效QTL的定位预测，应用该方法对双亲均为红皮梨的“满天红”ד红香酥”杂交组合红皮池和绿皮池进行分析，能够将所述“满天红”ד红香酥”杂交组合的东方梨红皮/绿皮性状位点定位在1.86Mb的区间内。
下载完整专利技术内容需要扣除积分，VIP会员可以免费下载。
该专利技术资料仅供研究查看技术是否侵权等信息，商用须获得专利权人授权。该专利全部权利属于中国农业科学院郑州果树研究所，未经中国农业科学院郑州果树研究所许可，擅自商用是侵权行为。如果您想购买此专利、获得商业授权和技术合作，请联系【客服】
本文链接：http://www.vipzhuanli.com/patent/201610291847.9/，转载请声明来源钻瓜专利网。
