[发明专利]一种利用质谱数据分析蛋白交联位点的方法

摘要

一种利用质谱数据分析蛋白交联位点的方法，首先利用合适的酶切方法，将蛋白质上可能的交联位点分开，并计算各包含潜在交联位点的肽段的分子量，预测理论交联片段的分子量和质荷比；常规质谱分析蛋白酶切片段后，通过质谱数据与理论预测值的比对，即可获得蛋白质交联位点信息。本发明的不需要复杂的公式或者程序，通过简单的计算及比对就能找出蛋白质间的交联位点，可以为交联反应位点与蛋白质性质变化的探讨提供依据。

主权项

一种利用质谱数据分析蛋白交联位点的方法，其特征是步骤如下：(1)理论酶切肽段的分析与筛选；选取合适的酶，以能将各交联位点分开为宜；根据所选择的酶的特异性酶切位点，列出酶切后可能出现的所有片段，筛选出含有潜在交联位点的酶切片段，并计算每个肽段的分子量；(2)理论交联片段分子量的预测；将步骤(1)中含有潜在交联位点的片段进行组合，即获得理论交联片段库；计算理论交联片段库中各交联片段的分子量：理论交联片段的分子量为交联片段的分子量之和减去交联反应时消去基团的分子量，或者理论交联片段的分子量为交联片段的分子量之和加上交联反应时附加基团的分子量；再根据可能的电荷量计算获得的各交联片段可能的质荷比；(3)交联蛋白的酶切及质谱分析；采用步骤(1)选择的蛋白酶对交联复合物进行酶切，并按照常规方法对酶切片段进行质谱分析；(4)数据比对与分析；查看质谱数据，得到各峰对应的质荷比，与步骤(2)计算的理论交联片段质荷比进行匹配，匹配成功则理论的交联片段即为实际交联片段，理论预测的交联位点为真，由此获知蛋白质交联的位点。