[发明专利]一种利用质谱数据分析蛋白交联位点的方法

权利要求书

1.一种利用质谱数据分析蛋白交联位点的方法，其特征是步骤如下：

(1)理论酶切肽段的分析与筛选；

选取合适的酶，以能将各交联位点分开为宜；根据所选择的酶的特异性酶切位点，列出 酶切后可能出现的所有片段，筛选出含有潜在交联位点的酶切片段，并计算每个肽段的分 子量；

(2)理论交联片段分子量的预测；

将步骤(1)中含有潜在交联位点的片段进行组合，即获得理论交联片段库；计算理论交 联片段库中各交联片段的分子量：理论交联片段的分子量为交联片段的分子量之和减去交 联反应时消去基团的分子量，或者理论交联片段的分子量为交联片段的分子量之和加上交 联反应时附加基团的分子量；再根据可能的电荷量计算获得的各交联片段可能的质荷比；

(3)交联蛋白的酶切及质谱分析；

采用步骤(1)选择的蛋白酶对交联复合物进行酶切，并按照常规方法对酶切片段进行 质谱分析；

(4)数据比对与分析；

查看质谱数据，得到各峰对应的质荷比，与步骤(2)计算的理论交联片段质荷比进行匹 配，匹配成功则理论的交联片段即为实际交联片段，理论预测的交联位点为真，由此获知蛋 白质交联的位点。