[发明专利]一种利用质谱数据分析蛋白交联位点的方法在审
申请号: | 201610012183.8 | 申请日: | 2016-01-11 |
公开(公告)号: | CN105651852A | 公开(公告)日: | 2016-06-08 |
发明(设计)人: | 吴志华;赵瑞芳;连君;陈红兵;李欣;佟平;杨安树 | 申请(专利权)人: | 南昌大学 |
主分类号: | G01N27/62 | 分类号: | G01N27/62 |
代理公司: | 南昌新天下专利商标代理有限公司 36115 | 代理人: | 施秀瑾 |
地址: | 330031 江西省*** | 国省代码: | 江西;36 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 利用 数据 分析 蛋白 交联 方法 | ||
技术领域
本发明涉及的蛋白质交联位点分析,涉及食物蛋白的交联加工改性。
背景技术
蛋白质交联指的是通过一定的化学试剂或催化剂,在蛋白质内部多肽链之间或蛋 白质之间形成共价键,从而起到改善蛋白质功能性质的目的,交联过程中,共价键的形成可 能伴随着消去部分基团,也可能伴随着附加部分基团。目前蛋白质交联广泛应用于植物蛋 白,肉制品以及烘焙食品等的加工中,它可以改变蛋白之的结构和性质,从而改善蛋白质的 品质。例如,转谷氨酰氨酶可以催化花生过敏原蛋白Arah2发生交联反应,降低其致敏性, 改善其消化性。
交联后蛋白性质的变化与其交联位点有着密切的关系,比如戊二醛与大豆蛋白交 联后,大豆蛋白疏水性显著增加,溶解性降低,这些性质的改进都涉及到蛋白质的交联位 点。因交联位点的不同对蛋白的高级结构影响,对蛋白的功能改变都不同,因此交联位点的 鉴定对蛋白性质的变化具有重要意义。目前尚无比较简单合适的蛋白质交联位点鉴定方 法。
发明内容
本发明的目的在于提供一种利用质谱数据分析蛋白交联位点的方法,寻找和发现 蛋白质交联反应发生的位点。本发明的方法通过分析质谱数据,将理论交联肽段质荷比与 质谱数据进行比对,搜寻蛋白质的交联位点。
本发明是通过以下技术方案实现的。
本发明所述的一种利用质谱数据分析蛋白交联位点的方法,具体步骤如下:
(1)理论酶切肽段的分析与筛选。
选取合适的酶,以能将各交联位点分开为宜。根据所选择的酶的特异性酶切位点, 列出酶切后可能出现的所有片段,筛选出含有潜在交联位点的酶切片段,并计算每个肽段 的分子量。
(2)理论交联片段分子量的预测。
将步骤(1)中含有潜在交联位点的片段进行组合,即获得理论交联片段库。计算理 论交联片段库中各交联片段的分子量(理论交联片段的分子量为交联片段的分子量之和减 去交联反应时消去基团的分子量,或者理论交联片段的分子量为交联片段的分子量之和加 上交联反应时附加基团的分子量),再根据可能的电荷量计算获得的各交联片段可能的质 荷比。
(3)交联蛋白的酶切及质谱分析。
采用步骤(1)选择的蛋白酶对交联复合物进行酶切,并按照常规方法对酶切片段 进行质谱分析。
(4)数据比对与分析。
用相应软件查看质谱数据,得到各峰对应的质荷比,与步骤(2)计算的理论交联片 段质荷比进行匹配,匹配成功则理论的交联片段即为实际交联片段,理论预测的交联位点 为真,由此获知蛋白质交联的位点。
本发明利用质谱分析的数据来实现蛋白质的交联位点分析。质谱法是一种同时具 备高特异性和高灵敏度且得到了广泛应用的普适性方法,能够准确地测定生物大分子的分 子量,获得的数据可以用于蛋白质的交联位点分析。
本发明的技术效果在于不需要复杂的计算公式或者程序,只需要简单的计算及比 对就能找出蛋白质间的交联位点。
附图说明
图1为本发明质谱分析数据及比对结果。
具体实施方式
本发明将通过以下实施例作进一步说明。
实施中,选用转谷氨酰胺酶催化交联的花生过敏原蛋白Arah2.02为研究对象, 在SDS-PAGE电泳胶图中切出交联的蛋白条带,选用胰蛋白酶进行酶切,可以将交联位点K分 开,再经液质联用分析,得到的质谱数据利用MZmine软件(可以查看每个峰对应的质荷比及 所带的电荷量)打开查看,进行数据比对获知交联位点。具体实施步骤如下:
(1)胰蛋白酶理论酶切肽段的分析与筛选。
首先,选择胰蛋白酶酶切,它能将可能的参与交联位点K逐一分开。蛋白交联复合 物选用胰蛋白酶进行酶切,花生过敏原蛋白Arah2.02中共有个3赖氨酸,酶切将这三个可 能的交联位点分开。
根据Arah2.02的氨基酸序列以及胰蛋白酶的酶切位点,可得到胰蛋白酶作用后 Arah2.02蛋白的理论分子片段,如表1所示。由于转谷氨酰胺酶催化交联反应的催化位点 为赖氨酸(K)与谷氨酰胺(Q),因此能够参与交联反应的片段必定是含有K或Q的片段,经过 筛选,含有Q的片段共有17个,含有K的片段共有4个,这些可能的交联片段及其分子量如表2 所示。
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