[发明专利]基于单样本外周血检测胎儿染色体非整倍性的装置有效
申请号: | 201510316254.9 | 申请日: | 2015-06-10 |
公开(公告)号: | CN104951671B | 公开(公告)日: | 2017-09-19 |
发明(设计)人: | 尹鸿瑛;彭春方;何铮;陈丹;陈样宜;黄铨飞 | 申请(专利权)人: | 东莞博奥木华基因科技有限公司 |
主分类号: | G06F19/22 | 分类号: | G06F19/22 |
代理公司: | 广州嘉权专利商标事务所有限公司44205 | 代理人: | 谭英强,许飞 |
地址: | 523808 广东省东莞市松山湖高*** | 国省代码: | 广东;44 |
权利要求书: | 查看更多 | 说明书: | 查看更多 |
摘要: | 本发明公开了一种基于单样本外周血检测胎儿染色体非整倍性的装置,包括测序数据处理单元和结果分析单元,通过比较100~149 bp的短序列和150~199 bp的长序列在同一染色体上的量,判断为该待测染色体是否为非整倍染色体。本发明的装置通过样本自身对照,准确性高;对胎儿游离DNA浓度的依赖性较小,很大程度上解决了低胎儿游离DNA浓度下染色体非整倍体的假阴性问题;而且对测序的数据量要求比原有的方法低,从而可以进一步降低成本。 | ||
搜索关键词: | 基于 样本 外周血 检测 胎儿 染色体 非整倍性 装置 | ||
【主权项】:
一种基于单样本外周血检测胎儿染色体非整倍性的装置,包括:测序数据处理单元:用于将测序得到的核苷酸序列与人类基因组标准序列进行对比,确定核苷酸序列对应的染色体;结果分析单元:将属于同一染色体上的核苷酸序列划分为短序列和长序列,其中,短序列的长度为100bp~149 bp,长序列的长度为150bp~199 bp;当待测染色体为常染色体时,属于同一染色体的短序列的量比长序列的量多时,判断该待测染色体为非整倍染色体;结果分析单元进行分析时,采用滑窗法计算待测染色体上每个长度区间的DNA片段比例,通过对比短序列和长序列区间的DNA片段比例判断待测染色体是否为非整倍染色体。
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G06 计算;推算;计数
G06F 电数字数据处理
G06F19-00 专门适用于特定应用的数字计算或数据处理的设备或方法
G06F19-10 .生物信息学,即计算分子生物学中的遗传或蛋白质相关的数据处理方法或系统
G06F19-12 ..用于系统生物学的建模或仿真,例如:概率模型或动态模型,遗传基因管理网络,蛋白质交互作用网络或新陈代谢作用网络
G06F19-14 ..用于发展或进化的,例如:进化的保存区域决定或进化树结构
G06F19-16 ..用于分子结构的,例如:结构排序,结构或功能关系,蛋白质折叠,结构域拓扑,用结构数据的药靶,涉及二维或三维结构的
G06F19-18 ..用于功能性基因组学或蛋白质组学的,例如:基因型–表型关联,不均衡连接,种群遗传学,结合位置鉴定,变异发生,基因型或染色体组的注释,蛋白质相互作用或蛋白质核酸的相互作用
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