[发明专利]一种基于SNP芯片的综合基因组育种值估计方法及应用在审
| 申请号： | 201410067189.6 | 申请日： | 2014-02-26 |
| 公开（公告）号： | CN103914631A | 公开（公告）日： | 2014-07-09 |
| 发明（设计）人： | 丁向东;张勤;李秀金;王胜;张哲;王重龙;黄菊;李乐义 | 申请（专利权）人： | 中国农业大学 |
| 主分类号： | G06F19/24 | 分类号： | G06F19/24 |
| 代理公司： | 北京路浩知识产权代理有限公司 11002 | 代理人： | 王文君 |
| 地址： | 100193 *** | 国省代码： | 北京;11 |
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| 摘要： | 本发明属于生物信息学技术领域，提供了一种基于SNP芯片的综合基因组育种值估计方法，步骤S1，获取数据文件，并对数据文件进行预处理，获得可靠的预处理数据；步骤S2，对步骤S1获得的预处理数据进行基因组育种值估计，利用GBLUP方法估计基因组育种值，或者利用贝叶斯方法估计基因组育种值，获得单个性状的个体基因组育种值；步骤S3，综合基因组育种值估计，重复步骤S2，获得多个性状的个体基因组育种值，计算综合基因组育种值。本方法整合了SNP芯片信息、系谱信息、表型信息，可对动物的育种选留做出判断，可推进基因组选择在国内动物育种领域的应用，可更好地发挥基因组选择在动物育种领域的优势。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 基于 snp 芯片 综合 基因组 育种 估计 方法 应用 | ||
【主权项】：
一种基于SNP芯片的综合基因组育种值估计方法，其特征在于，所述方法包括：步骤S1，获取数据文件，并对所述数据文件进行预处理，获得可靠的预处理数据；步骤S2，对步骤S1获得的预处理数据进行基因组育种值估计，利用GBLUP方法估计基因组育种值，或者利用贝叶斯方法估计基因组育种值，获得单个性状的个体基因组育种值；步骤S3，综合基因组育种值估计，重复步骤S2，获得多个性状的个体基因组育种值，计算综合基因组育种值。
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G06 计算；推算；计数
G06F 电数字数据处理
G06F19-00 专门适用于特定应用的数字计算或数据处理的设备或方法
G06F19-10 .生物信息学，即计算分子生物学中的遗传或蛋白质相关的数据处理方法或系统
G06F19-12 ..用于系统生物学的建模或仿真，例如：概率模型或动态模型，遗传基因管理网络，蛋白质交互作用网络或新陈代谢作用网络
G06F19-14 ..用于发展或进化的，例如：进化的保存区域决定或进化树结构
G06F19-16 ..用于分子结构的，例如：结构排序，结构或功能关系，蛋白质折叠，结构域拓扑，用结构数据的药靶，涉及二维或三维结构的
G06F19-18 ..用于功能性基因组学或蛋白质组学的，例如：基因型–表型关联，不均衡连接，种群遗传学，结合位置鉴定，变异发生，基因型或染色体组的注释，蛋白质相互作用或蛋白质核酸的相互作用
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