[发明专利]离子激流基因组测序在审

专利信息
申请号: 201380024174.5 申请日: 2013-05-09
公开(公告)号: CN104508142A 公开(公告)日: 2015-04-08
发明(设计)人: L.T.道姆;G.W.费希尔 申请(专利权)人: 长角牛疫苗和诊断有限责任公司
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68;C12Q1/70;C12Q1/04;C12R1/93;C12R1/32
代理公司: 中国专利代理(香港)有限公司 72001 代理人: 李慧惠;梁谋
地址: 美国马*** 国省代码: 美国;US
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摘要: 公开了用于通过半导体测序,优选离子激流测序快速且成本节约地分析微生物序列的增强方法。这种方法提供了多个基因组的全长分析和多个区域(例如基因)分析。这些方法鉴定负责对抗生素或其它化学化合物赋予抗性或敏感性的特定基因的遗传突变。将特定生物体的多种不同种、株系和/或血清型连同生物体的完整基因组快速且有效筛选并鉴定突变。通过选择产生具有跨越整个基因组的序列的扩增子的相似大小和GC含量的引物对,通过离子激流方法分析的单一PCR反应可以测定完整基因组的序列。方法可用于测序病毒因子(诸如流感病毒)和细菌因子(诸如结核病细菌)的基因组。
搜索关键词: 离子 激流 基因组
【主权项】:
鉴定微生物中的核酸序列基序的方法,其包括:提供多种核酸样品,每种样品获自所述微生物的不同菌株或血清型;通过聚合酶链式反应扩增所述多种核酸样品的序列;通过离子激流测序获得经扩增的序列的序列信息;从获得的序列信息确定至少一种微生物菌株或血清型的基因组中的多态性;和将鉴定的多态性与所述至少一种微生物菌株或血清型的表型或基因组位置关联,以鉴定所述核酸序列基序。
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