[发明专利]进行凡纳滨对虾家系鉴定的多重微卫星鉴定体系及应用有效
申请号: | 201310340730.1 | 申请日: | 2013-08-07 |
公开(公告)号: | CN103468796A | 公开(公告)日: | 2013-12-25 |
发明(设计)人: | 于洋;李富花;张晓军;相建海 | 申请(专利权)人: | 中国科学院海洋研究所 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
代理公司: | 沈阳科苑专利商标代理有限公司 21002 | 代理人: | 马驰 |
地址: | 266071*** | 国省代码: | 山东;37 |
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摘要: | 本发明涉及一种快速高效进行凡纳滨对虾家系鉴定的多重微卫星鉴定体系,属于遗传育种中的分子辅助育种领域,具体地说,通过筛选多态性高的15个微卫星位点进行引物设计,根据引物退火温度和扩增产物长度分成两个引物体系,每一组内根据片段大小对引物进行不同的荧光标记,通过体系优化获得最佳扩增体系,进而通过该多重微卫星鉴定体系对候选父母本和子代进行微卫星分型,利用15个位点的分型数据进行家系鉴定,效率快,结果准确可靠,并且对于亲缘关系较近的家系也有很好的鉴定效果。 | ||
搜索关键词: | 进行 凡纳滨 对虾 家系 鉴定 多重 卫星 体系 应用 | ||
【主权项】:
进行凡纳滨对虾家系鉴定的多重微卫星鉴定体系,包括多重微卫星引物体系,其特征在于:使用多态性高的LvM1‑LvM15共15对微卫星引物构成两个多重微卫星引物体系,所述的两个多重微卫星引物体系如下:1)多重微卫星引物体系1的引物序列和荧光标记组合为:LvM1F:6‑FAM(羧基荧光素)‑5’‑GATGACCTGCCTTTCTCTGC‑3’LvM1R:5’‑GGGAGAGATGATGGGAAGAAG‑3’LvM2F:ROX(羧基X罗丹明)‑5’‑ATGGCACAAATAGGATCTTG‑3’LvM2R:5’‑GACTGGAAGAGCACTGATTC‑3’LvM3F:HEX(六氯荧光素)‑5’‑ATACGAAACACCCCATCCC‑3’LvM3R:5’‑GTGGTCTTACCTCGTGGCTC‑3’LvM4F:TAMRA(羧基四甲基罗丹明)‑5’‑AGCACCTAGCACTTGCTGAAC‑3’LvM4R:5’‑AGAGACTCACATCCTCATCCTC‑3’LvM5F:6‑FAM(羧基荧光素)‑5’‑CATTGAAAACGGAATCCTCG‑3’LvM5R:5’‑GATATTCCCATCAACACAGCG‑3’LvM6F:ROX(羧基X罗丹明)‑5’‑CACCAAAACGAACGAAACG‑3’LvM6R:5’‑GGATAAAAACGAATTGTATACCG‑3’LvM7F:HEX(六氯荧光素)‑5’‑GAGAGCAAATAAGAAAGGGC‑3’LvM7R:5’‑AGGATGCAAATGATAACGAG‑3’LvM8F:TAMRA(羧基四甲基罗丹明)‑5’‑GGCACACTGTTTAGTCCTCG‑3’LvM8R:5’‑CGAACAGAATGGCAGAGGAG‑3’LvM9F:6‑FAM(羧基荧光素)‑5’‑CCCGACTTGGCTTTTAGTTG‑3’LvM9R:5’‑GAGATTGCTATCCTCGGCTG‑3’LvM10F:ROX(羧基X罗丹明)‑5’‑GATCCTGCGAGTCACTTTATCTC‑3’LvM10R:5’‑TTTATTGCGTATCCCAGAAGC‑3’2)多重微卫星引物体系2的引物和荧光标记组合如下:LvM11F:6‑FAM(羧基荧光素)‑5’‑CCGCCATCATCATCAACA‑3’LvM11R:5’‑TCATTCGGGTTCGAGACTC‑3’LvM12F:ROX(羧基X罗丹明)‑5’‑GATCATTCGCCCCTCTTTTT‑3’LvM12R:5’‑ATCTACGGTTCGAGAGCAGA‑3’LvM13F:HEX(六氯荧光素)‑5’‑GGACTCACACTTCTGGTTC‑3’LvM13R:5’‑GGCTGCACCTTGTAAGTC‑3’LvM14F:TAMRA(羧基四甲基罗丹明)‑5’‑TATGCTCGTTCCCTTTGCTT‑3’LvM14R:5’‑TTGAAGGAAAAGTGTTGGGG‑3’LvM15F:6‑FAM(羧基荧光素)‑5’‑ACTAGTGGATCTGTCTATTCAT‑3’LvM15R:5’‑ATACCCACCCATGCATGTTA‑3’。
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