[发明专利]基于复空间多视角特征融合的膜蛋白亚细胞位置定位方法

摘要

本发明公开了一种基于复空间多视角特征融合的膜蛋白亚细胞位置定位方法。首先提取蛋白质序列的伪氨基酸组成成分(PseAAC)特征和基于自相关变换的位置特异性得分矩阵(PSSM-ACT)特征；其次，使用并行方式，将这两种特征组合成复空间中的特征向量；第三，使用广义的主成分分析(GPCA)方法对并行组合后的复特征进行降维，以去除噪音；最后，使用基于优化证据理论的K近邻分类器(OET-KNN)对融合后的特征进行分类，从而确定亚细胞位置。该方法的优点：一是采用复空间多视角特征融合技术，有效地抽取蛋白质序列的鉴别特征；二是使用了基于优化证据理论的K近邻分类器，提高了膜蛋白亚细胞位置定位的准确率。

主权项

基于复空间多视角特征融合的膜蛋白亚细胞位置定位方法，其特征在于包括以下三个步骤：第一步：多视角特征提取：基于蛋白质的氨基酸组成信息和氨基酸序列顺序信息，提取伪氨基酸组成成分特征PseAAC；使用PSI‑BLAST获取待定位蛋白质序列的进化信息PSSM，然后从PSSM提取基于自相关变换的位置特异性得分矩阵特征PSSM‑ACT；第二步：先对第一步中提取的两种特征进行并行特征组合，得到的特征位于复空间；然后，使用广义主分量分析对组合后的特征进行降维，得到融合后的特征；第三步：建立定位预测模型，使用基于优化证据理论的K近邻分类器OET‑KNN作为定位预测模型，预测膜蛋白的亚细胞位置。