[发明专利]分子动力学计算的实现方法和装置在审
| 申请号： | 201110403579.2 | 申请日： | 2011-12-06 |
| 公开（公告）号： | CN103150463A | 公开（公告）日： | 2013-06-12 |
| 发明（设计）人： | 何牧君;何沧平;马少杰;陈伟;占杰;李斌;吴宏文;顾小宝;曹征 | 申请（专利权）人： | 曙光信息产业股份有限公司 |
| 主分类号： | G06F19/00 | 分类号： | G06F19/00 |
| 代理公司： | 北京德恒律师事务所 11306 | 代理人： | 陆鑫;房岭梅 |
| 地址： | 300384 天津市西青区华*** | 国省代码： | 天津;12 |
| 权利要求书： | 查看更多 | 说明书： | 查看更多 |
| 摘要： | 本发明公开了一种分子动力学计算的实现方法和装置，该方法包括：接收用户通过图形化界面输入的计算任务；将计算任务中需要计算的数据分配给图形处理器GPU和中央处理器CPU；GPU和CPU根据分子动力学的计算方法，对各自分配到的需要计算的数据进行分子动力学计算。本发明通过提供可视化界面方便用户输入任务，并将分配的任务交由CPU和GPU共同完成，实现了计算系统的异构，并且能够有效提高计算的速度，使分子动力学的计算方案得到有效完善。 | ||
| 搜索关键词： | 分子 动力学 计算 实现 方法 装置 | ||
【主权项】：
一种分子动力学计算的实现方法，其特征在于，包括：接收用户通过图形化界面输入的计算任务；将所述计算任务中需要计算的数据分配给图形处理器GPU和中央处理器CPU；所述GPU和所述CPU根据分子动力学的计算方法，对各自分配到的所述需要计算的数据进行分子动力学计算。
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G06 计算；推算；计数
G06F 电数字数据处理
G06F19-00 专门适用于特定应用的数字计算或数据处理的设备或方法
G06F19-10 .生物信息学，即计算分子生物学中的遗传或蛋白质相关的数据处理方法或系统
G06F19-12 ..用于系统生物学的建模或仿真，例如：概率模型或动态模型，遗传基因管理网络，蛋白质交互作用网络或新陈代谢作用网络
G06F19-14 ..用于发展或进化的，例如：进化的保存区域决定或进化树结构
G06F19-16 ..用于分子结构的，例如：结构排序，结构或功能关系，蛋白质折叠，结构域拓扑，用结构数据的药靶，涉及二维或三维结构的
G06F19-18 ..用于功能性基因组学或蛋白质组学的，例如：基因型–表型关联，不均衡连接，种群遗传学，结合位置鉴定，变异发生，基因型或染色体组的注释，蛋白质相互作用或蛋白质核酸的相互作用
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