[发明专利]栎枯萎病菌实时荧光PCR检测方法无效
申请号: | 200910034194.6 | 申请日: | 2009-09-02 |
公开(公告)号: | CN101701247A | 公开(公告)日: | 2010-05-05 |
发明(设计)人: | 吴翠萍;陈贯源;李彬;粟寒;郑斯竹;安榆林;叶建仁 | 申请(专利权)人: | 江苏出入境检验检疫局动植物与食品检测中心 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;G01N21/64;C12R1/645 |
代理公司: | 南京众联专利代理有限公司 32206 | 代理人: | 王荷英 |
地址: | 210001*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | 本发明涉及一种栎枯萎病菌实时荧光PCR检测方法,以样品DNA作为模板,利用特异性引物CF01/CF02以及荧光染料SYBR Green I进行栎枯萎病菌的Real-timePCR扩增,体系在ABI 7500Fast荧光定量PCR仪中预扩增95℃30秒,接着95℃3秒,60℃延伸25秒,共40个循环,在每个循环的延伸阶段同步多次采集荧光;立即进行熔解曲线分析,程序为:95℃,1min;60℃,1min;从60℃开始每升高0.5℃保持10s,连续升高70次,直到95℃为止;如果扩增图谱有出现明显的“S”形曲线,且融解曲线中的Tm吸收峰值与阳性对照的相一致,表示所检测的病菌样品为栎枯萎病菌。本方法对栎枯萎病菌检测灵敏度高,方便快速,可用于各检疫口岸对原木、木质包装、植物性材料以及随之携带的土壤栎枯萎病菌的实时监控。 | ||
搜索关键词: | 枯萎 病菌 实时 荧光 pcr 检测 方法 | ||
【主权项】:
栎枯萎病菌实时荧光PCR检测方法,其特征是包含如下步骤:①.提取栎枯萎病菌待检样品的DNA,低温冷冻保存备用;②.设计一对能鉴别栎枯萎病菌的特异性引物CF01/CF02,其序列为:上游引物CF01:5’-GGCAGGGACTTCTTTCTT-3’;下游引物CF02:5’-AAGGCTTGAGTGGTGAAA-3’;③.利用特异性引物CF01/CF02,以及荧光染料SYBR Green I对样品DNA进行扩增:扩增反应体系包含基因组DNA 1μl、10μM的上、下游引物CF01/CF02各0.4μl、SYBR premix Ex Taq(2×)0.4μl、Rox DyeII0.4μl,灭菌水补足20μl;以上体系预扩增95℃30秒,接着95℃3秒,60℃延伸25秒,共40个循环,在每个循环的延伸阶段同步多次采集荧光;立即进行熔解曲线分析,程序为:95℃,1min;60℃,1min;从60℃开始每升高0.5℃保持10s,连续升高70次,直到95℃为止;④.扩增结果分析PCR扩增结束后利用ABI 7500Fast荧光定量PCR仪自带的分析软件,对得到的扩增图谱和融解曲线进行分析,如果扩增图谱有出现明显的“S”形曲线,且融解曲线中的Tm吸收峰值与阳性对照一致,则说明所检测的病菌样品为栎枯萎病菌。
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