[发明专利]基于DNA自动机过程的双链DNA序列测定的方法无效
申请号: | 200410093095.2 | 申请日: | 2004-12-16 |
公开(公告)号: | CN1661102A | 公开(公告)日: | 2005-08-31 |
发明(设计)人: | 张治洲;胡钧;贺林 | 申请(专利权)人: | 上海交通大学 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
代理公司: | 上海交达专利事务所 | 代理人: | 王锡麟;王桂忠 |
地址: | 200240*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | 一种基于DNA自动机过程的双链DNA序列测定的方法。本发明中双链DNA序列作为输入分子,由限制性内切酶对DNA进行切割,露出粘性末端,与状态转移分子通过碱基配对相结合并发生连接。由于状态转移分子仍然含有限制性内切酶的识别位点,连接后的DNA分子继续新一轮的切割和连接循环并使作为输入分子的DNA序列逐渐变短,作为输入分子的DNA序列逐渐变短,输入分子的长度变化反映了DNA序列的信息,该长度变化是可阅读的,通过设计状态转移分子的结构可以实现输入分子的长度递减的速度为每次1个碱基。本发明有效地避免单链DNA分子高级结构引起的测序困难,克服现有技术中单链模板二级结构影响测序的不足,并在此基础上降低成本,具有很大的应用前景。 | ||
搜索关键词: | 基于 dna 自动机 过程 序列 测定 方法 | ||
【主权项】:
1.一种基于DNA自动机过程的双链DNA序列测定的方法,其特征在于,双链DNA序列作为输入分子,由限制性内切酶对DNA进行切割,露出粘性末端,与状态转移分子通过碱基配对相结合,在连接酶作用下发生连接;由于状态转移分子仍然含有限制性内切酶的识别位点,连接后的DNA分子继续新一轮的切割和连接循环并使作为输入分子的DNA序列逐渐变短,作为输入分子的DNA序列逐渐变短,输入分子的长度变化反映了DNA序列的信息,通过设计状态转移分子的结构可以实现输入分子的长度递减的速度为每次1个碱基。
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