本发明公开了一种对PEG化的尿酸酶进行纯化的方法,具体地,本发明公开了的方法包括如下步骤:(i)提供一待纯化的原料,其中所述原料含有PEG化的尿酸酶、没有连接上PEG的尿酸酶和游离PEG;(i i)将所述待纯化的原料上样于阳离子交换柱,使得所述PEG化的尿酸酶结合于所述的阳离子交换柱;(i i i)用洗脱液对上样后的阳离子交换柱进行洗脱,从而获得含PEG化的尿酸酶的洗脱液(Elution),即为经纯化的PEG化的尿酸酶。用该方法纯化得到的PEG化的尿酸酶具有很高的纯度,因此,具有广泛的应用前景。