本申请涉及一种尖鳞伞的特异性基因及其应用,其中,所述特异性基因短序列SEQ ID NO.1:ATTGAATTACCTATCCAAGGTGACTTGGGGA,应用上述的特异性基因进行尖鳞伞分子鉴定的方法,包括如下步骤:(1)从待测样品组织中提取基因组DNA;(2)以步骤(1)所提取的基因组DNA为模板,用尖鳞伞特异性引物进行聚合酶链式反应,获得扩增DNA产物;(3)对步骤(2)扩增得到的DNA产物进行测序;(4)将测序结果拼接校对后获得扩增片段,检测所述扩增片段中是否存在所述特异性基因短序列SEQ ID NO.1,若存在这一片段,即可将该样品鉴定为尖鳞伞。本申请所提供的特异性短序列和方法可以快速准确的将毒蘑菇尖鳞伞从易混淆的可食蘑菇中准确鉴定出来,且这种特异性短序列易扩增,操作简便,适用性广。