本发明公开了一种西瓜果皮黄斑性状紧密连锁的SSR分子标记、检测方法及应用，属于分子标记技术领域。本发明公开的一种西瓜果皮黄斑性状紧密连锁的SSR分子标记，核苷酸序列为SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.2；SEQ ID NO.1所示核苷酸序列与西瓜果皮无黄斑性状紧密连锁，SEQ ID NO.2所示核苷酸序列与西瓜果皮有黄斑性状紧密连锁。本发明已经开发的分子标记W072823与西瓜果皮黄斑性状紧密连锁，因而对西瓜果皮黄斑性状分子标记辅助育种体系的建立更有帮助。本发明的分子标记可以简便、快速、高通量地应用于西瓜育种实践。
本发明公开了一种甜瓜雌性系的InDel标记CmF03、检测方法及应用。涉及分子标记技术领域。SEQ ID NO.1所示的核苷酸序列与甜瓜雌性系性状高度连锁；SEQ ID NO.2所示的核苷酸序列与甜瓜非雌性性状高度连锁，还提供了检测引物和试剂盒。本发明通过利用的甜瓜SSR数据库以及两亲本(雌性和雄性)重测序数据，根据两亲本构建极端池进行多态性引物的筛选，并用多态性引物扫描F2分离群体，结合群体植株的花性型表型以及亲本重测序结果，开发与雌性株调控基因连锁更加紧密的分子标记。因而对甜瓜雌性株性状分子标记辅助育种体系的建立更有帮助。可以简便、快速、高通量地应用于甜瓜育种实践。
