本发明公开一种DNA微阵列芯片及其检测方法和在检测CYP3A4、CYP3A5和MDR1基因多态性上的应用,该芯片包括固相载体和探针,其探针的核苷酸序列如探针的核苷酸序列如SEQ ID No:1~SEQ ID No:49所示。本发明通过先将探针点载在固相载体上,然后标记并制备待测样品的目的核苷酸序列,接着将该目的核苷酸序列与芯片上的探针进行杂交,最后对杂交结果进行检测便可得到待测样品中CYP3A4、CYP3A5和MDR1基因的信息。本发明的芯片可以一次性对多个样本同时进行多项基因的检测,操作简单,结果准确性高,通过一次检测即可获得患者的大量遗传信息,可用于指导制定合理用药方案,实现个性化医疗。