本发明公开了一种检测水稻功能基因的引物组、引物池、试剂盒及其应用,属于生物技术领域。所述引物组包括第1引物对至第250引物对,每个所述引物对均包括正向引物和反向引物,所述第1引物对的正向引物、所述第1引物对的反向引物至所述第250引物对的正向引物和第250引物对的反向引物依次如序列表中SEQ ID NO:1至SEQ ID NO:500所示。采用该引物组和引物池能够同一反应体系中针对多个基因进行多重PCR扩增,这大大简化了操作步骤,提高了扩增的效率,同时能够保证较高的成功率,并降低基因的漏检率。
本发明发明了一种鉴定水稻功能基因的引物组、试剂盒及应用。该引物组包括:第1引物对至第30引物对,每个引物对均包括正向引物和反向引物,第1引物对的正向引物、第1引物对的反向引物至第30引物对的正向引物和第30引物对的反向引物依次如序列表中SEQ ID NO:1至SEQ ID NO:60所示。本发明实施例提供的引物组及试剂盒,通过多重扩增和高通量测序获得待测样本中目标基因的数据是一条条的碱基序列,分辨率达到单碱基水平,数据准确性和信息化程度高,可以通过序列分析软件一次性对成百上千个样品进行序列比对分析,快速统计待测样本中目标性状基因的序列,易于鉴别多等位基因型和新型等位基因,且准确率高重现率高。
本发明公开了一种用于水稻光温敏雄性不育基因pms3分子标记的引物及方法,该引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.1、SEQ ID NO.2和SEQ ID NO.3所示。本发明的用于水稻光温敏雄性不育基因pms3分子标记,只需要一次常规的PCR和琼脂糖凝胶电泳技术就可起到基因分型的作用,此外该引物只能扩增出一条目的条带,扩增结果一目了然,便于结果的记录,并且在整个操作过程中,操作步骤简单,操作时间短,实验所需的试剂和耗材成本低,加速了实验进程,节约了实验成本,达到了快速、便捷和可靠的分子标记辅助育种的目的。
本发明提供了一种水稻细长粒基因SLG7分子标记引物,包括:上游引物:核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示;下游引物:核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示。还提供了水稻细长粒基因SLG7分子标记,以所示分子标记引物对水稻基因组DNA进行PCR扩增得到。该标记引物用于扩增水稻基因组模板,PCR扩增产物进行凝胶电泳,检测PCR产物的带型若扩增出一98bp条带,即为SLG7基因型;若扩增条出一109bp条带,即为slg7基因型;若扩增出98bp和109bp两条带,即为杂合型。该分子标记引物可用于鉴定水稻长粒基因SLG7的基因型和水稻分子育种。