本发明属于大豆分子生物学及分子育种技术领域，具体涉及大豆百粒重与尺寸相关的SNP位点、分子标记、扩增引物及其应用。所述SNP位点位于大豆4号染色体的6,606,131bp，多态性为A或T，所述SNP位点的多态性为A的植株较多态性为T的植株的百粒重与尺寸更高。所述分子标记的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示，所述分子标记的扩增引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.2‑3所示，本发明SNP位点对百粒重贡献率为15.49‑19.62％，加性效应为3.56‑4.41g。以SNP位点开发了相应的分子标记，利用该标记在东北核心种质资源样本群中进行选择，可筛选到2020年和2021年75％该分子标记第200bp为A的品系百粒重高于17.58g和18.92g，精确度可达75％，大大减少了选择成本，提高了百粒重等籽粒大小相关品质改良的效率。
本发明属于大豆分子生物学及分子育种技术领域，具体涉及大豆百粒重相关的SNP位点、分子标记、扩增引物及其应用。所述SNP位点位于大豆14号染色体的20,241,144bp，多态性为A或T，所述SNP位点的多态性为A的植株的百粒重高于多态性为T的植株。所述分子标记的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示，所述分子标记的扩增引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.2‑3所示，本发明SNP位点的百粒重贡献率为21.47‑22.02％，加性效应为4.16‑4.60g。以该SNP位点开发了相应的分子标记，利用该标记在东北核心种质资源样本群中进行选择，可筛选到2020年和2022年71.47％该分子标记第248位为A的品系百粒重高于17.64g和19.03g，精确度可达71.47％，大大减少了选择成本，提高了品质改良的效率，加速大豆高产与优异性状的改良进程。
