本发明公开了一种用于检测鉴定水稻白叶枯病菌(Xanthomonasoryzae pv.oryzae，Xoo)的靶标，所述的靶标为如SEQ ID No.1所示的核苷酸序列。本发明还公开了一种用于检测鉴定水稻白叶枯病菌的引物对，包括正向引物5’‑CCTTCTGCAATCTATGGCACC‑3’和反向引物5’‑TAAATAACACGGTGAAGCCGAC‑3’。所述引物对用于PCR能且只能从包含Xoo DNA的样品中扩增出138bp的核酸片段，具有检测鉴定Xoo的特异性和通用性，实现准确检测鉴定Xoo。所述引物对适用于实时荧光定量PCR，检测灵敏度达到2.7×102fg/μL。
本发明公开了一种用于检测水稻细菌性穗枯病菌的引物探针组合及应用，属于分子生物学检测技术领域。所述引物包括上游引物和下游引物，其核苷酸序列分别如SEQ ID NO.1、SEQ ID NO.2所示；所述探针的核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示，所述探针修饰有荧光标记。本发明设计和筛选针对水稻细菌性穗枯病菌特异性的引物和探针，具有良好的特异性，灵敏度高。本发明通过对引物和探针以及反应体系和反应条件的优化，建立了可对水稻细菌性穗枯病菌实现准确定量的数字PCR检测方法，可应用于市售田间水稻种子的检测，尤其是针对带菌量低的水稻种子样品，该方法可以实现高效的绝对定量检测，具有重要的应用价值。
本发明公开了基于LFD‑RPA技术的水稻细菌性条斑病菌检测试剂盒及其引物探针组合物与应用。本发明具体地公开了特异性检测水稻细菌性条斑病菌(Xanthomonas oryzae pv.oryzicola)的试剂盒包括引物XOC367‑3F(SEQ ID No.1)、引物XOC367‑3R(SEQ ID No.2)和探针Probe(SEQ ID No.3)。本发明建立的基于LFD‑RPA技术的检测方法简捷、快速、灵敏、特异。对病菌DNA的检测灵敏度可达2.59×10‑4ng/μL，并且特异性好，与其他近缘种及其他属病原菌均无交叉反应，可应用于水稻种子样品检测工作中。
本发明公开了一种用于检测西瓜细菌性果斑病菌的LAMP引物及其检测方法，属于生物技术领域。所述的LAMP引物，包括2条外引物、2条内引物和1条环化引物，其核苷酸序列分别如SEQ ID NO.1‑5所示。本发明提供的LAMP引物对西瓜细菌性果斑病菌的检出具有特异性，检测灵敏度达到1.72×102fg/μL；利用本发明提供的检测方法，能够简单快速地对西瓜细菌性果斑病菌进行检测，结果肉眼可判断，且在LAMP反应前加入显色剂，大大降低了污染的可能性，适用于基层农业部门及相关检测部门的田间现场检测。
