本发明公开了一种猫ω干扰素、其编码基因及其表达和应用,本发明根据已公布的猫源fIFNω2蛋白的氨基酸序列,经过序列设计,筛选出如SEQ ID NO.1所示的重组蛋白,经过鉴定本申请所提出的SUMO融合标签表达纯化的fIFNω2重组蛋白具有优秀的特异性和较高的体外抗病毒活性,同时其在大肠杆菌中的表达量较高。提出的编码基因能够实现在大肠杆菌中高效表达,并提高重组蛋白的制备效率。利用上述制备表达方法可获得纯度较高、活性较好的重组蛋白,制备方法具有工艺简单、成本低廉、蛋白纯度高、易于放大生产的特点,利于工业生产和大规模的推广应用。