“杨童茜”申请（专利权）人搜索_中国专利权人_发明人_技术持有人_科研专家_钻瓜专利网

钻瓜专利网为您找到相关结果2个，建议您升级VIP下载更多相关专利

[发明专利]一种基于多重PCR的靶向病原体纳米孔测序快速分析方法-CN202310725183.2在审
发明人：余乐;李寅虎;王志富;武志慧;杨童茜;高军涛 -专利权人：佛山源生基因生物科技有限公司
申请日： 2023-06-16 - 公布日： 2023-09-19 - 主分类号： G16B30/10 文献下载
摘要：本发明涉及纳米孔测序技术领域，具体涉及一种基于多重PCR的靶向病原体纳米孔测序快速分析方法，该方法构建了两轮比对分析的病原识别算法，保证了识别的准确性和时效性。首先在第一轮比对中，通过使用两种快速比对软件——vsearch和minimap2，实现了针对典型数据(1Gb纳米孔测序数据)的物种初步判别；在第二轮验证分析中，使用BLAST精确比对算法将第一步判别的各个物种的读段与该物种参考序列进行比对验证，有效减少了精确比对的计算量，将典型数据耗时降低至10分钟内，通过构建该方法，实现了典型纳米孔测序数据在10分钟内的准确分析和报告生成，并可兼容二代测序数据分析。
一种基于多重 pcr 靶向病原体纳米孔测序快速分析方法

[发明专利]一种基于纳米孔测序的病毒实时自动分析方法及系统-CN202110326137.6在审
发明人：杜鹏程;余乐;杨童茜 -专利权人：北京源生康泰基因科技有限公司
申请日： 2021-03-26 - 公布日： 2021-07-09 - 主分类号： G16B30/10 文献下载
摘要：本发明公开了一种基于纳米孔测序的病毒实时自动分析方法及系统，包括：按照预设的时间间隔扫描测序数据存储文件夹中的文件，以确定新的测序数据文件；对每个新的测序数据文件进行完整性校验和格式处理，以确定待测文件；对所述待测文件中的每个测序读段数据进行数据清洗，以获取质量合格的第一测序读段数据；将每个第一测序读段数据与预设的病毒基因组参考序列进行比对，并根据第一比对结果筛选，以确定第二测序读段数据；将第二测序读段数据和已存储的测序读段数据进行合并，并和预设的病毒基因组参考序列进行比对，以获得第二比对结果；根据第二比对结果确定测序深度，根据测序深度确定参考基因组覆盖度，并根据参考基因组覆盖度确定分析结果。
一种基于纳米孔测序病毒实时自动分析方法系统