本发明公开的一种南果梨PuHDAC15基因及其应用,属于分子生物学中的基因工程领域,PuHDAC15的全长编码区序列如序列表SEQ ID NO:1所示;氨基酸序列如序列表SEQ ID NO:2所示。本发明提供的南果梨果实香气相关基因PuHDAC15并用于构建PuHDAC15基因的过表达及沉默载体,用农杆菌介导法瞬时侵染‘南果梨’果实,静置贮藏后与未注射果实相比,过表达PuHDAC15基因果实的香气含量明显降低,沉默PuHDAC15基因果实的香气含量明显增加。本发明利用基因工程技术,对提高果实香气含量提供了理论依据与技术手段,具有很大的应用价值。