本发明提供一种大豆抗花叶病毒基因GmNN1及其感病的等位基因，其核苷酸序列分别如SEQ ID No.1和SEQ ID No.2所示。本发明分析了GmNN1在不同大豆抗、感品种间的表达差异，阐明了GmNN1参与大豆抗SMV反应，研究了不同大豆抗、感SMV品种间的GmNN1基因序列差异，并依据序列差异开发了功能标记GmNN1‑AC/GmNN1‑GT，同时利用SMV抗感RIL群体验证了标记与大豆抗病性的关联，该标记能够区分不同抗感SMV大豆品种。研究结果可为大豆抗SMV育种提供功能基因与选择标记。本发明还提供了大豆抗花叶病毒基因GmNN1的功能标记鉴定方法及其在育种选择中的应用。
本发明涉及一种大豆紫色酸性磷酸酶GmPAP4及其编码基因与应用。所述大豆紫色酸性磷酸酶氨基酸序列如SEQ ID NO.2所示或该序列经替换、缺失或添加一个或几个氨基酸且具有同等功能的由SEQ ID NO.2衍生的氨基酸序列。大豆紫色酸性磷酸酶基因GmPAP4具有如SEQ ID No.1所示的核苷酸序列。本发明首次发现了大豆紫色酸性磷酸酶GmPAP4及其编码基因，为提高植株植酸磷利用率提供了新的候选基因，可利用基因工程手段进一步提高植株植酸磷利用率。
本发明涉及植物分子生物学领域，具体涉及一种大豆的GmPHR1基因及其编码的蛋白和应用。本发明提供一种大豆的GmPHR1蛋白，1)、由SEQ ID No.2所示氨基酸组成的蛋白质；或2)、在SEQ ID No.2所示的氨基酸序列经取代、缺失或添加一个或几个氨基酸且具有同等活性的由1)衍生的蛋白质。本发明还提供编码上述蛋白的基因，及其在培育耐低磷植物新品种中的应用。GmPHR1的转基因植物与野生型相比表现出更强的耐低磷胁迫的能力。
