本发明公开了一种与甜瓜蔓枯病抗性基因gsb‑5共分离的InDel分子标记，为SEQ ID NO：1所示的核苷酸序列片段。通过构建F2群体，利用BSA方法结合全基因组重测序对甜瓜抗蔓枯病性状进行基因定位，在两亲本之间具有多态性的位点设计开发InDel分子标记，最终挖掘到了一个与甜瓜蔓枯病抗性基因gsb‑5共分离的分子标记，扩增到的片段与抗病性状共分离。本发明提供的分子标记可以有效、快速的区分甜瓜蔓枯病抗、感单株，可作为一种有效的手段用于甜瓜蔓枯病抗病育种。
本发明公开了一种与甜瓜蔓枯病抗性基因Gsb‑2共分离的InDel分子标记，为SEQ ID NO：1所示的核苷酸序列片段。通过构建F2群体，利用BSA方法结合全基因组重测序对甜瓜抗蔓枯病性状进行基因定位，在两亲本之间具有多态性的位点设计开发InDel分子标记，最终挖掘到了一个与甜瓜蔓枯病抗性基因Gsb‑2共分离的分子标记，扩增到的片段与抗病性状共分离。本发明提供的分子标记可以有效、快速的区分甜瓜蔓枯病抗、感单株，提高了甜瓜蔓枯病抗性表型鉴定的准确性，可作为一种有效的手段用于甜瓜蔓枯病抗病育种。
本发明公开了一种与甜瓜白粉病抗性相关的InDel分子标记及应用，本发明提供的InDel分子标记与甜瓜6号染色体上的抗病基因紧密相连，引物核苷酸序列如SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.2所示，命名为PM‑06InDel，通过本发明获得的与甜瓜白粉病抗性相关的InDel分子标记可以用于甜瓜材料的检测，能够快速区分甜瓜材料是否对白粉病具有抗性，用于甜瓜抗白粉病的分子标记辅助选择育种，可用于甜瓜白粉病抗性品种的早期筛选，缩短育种年限，提高育种效率。
本申请公开了与苦瓜果皮形态关联的分子标记及应用。其中，果皮形态包括连续脊和无连续脊两种类型；该分子标记位于苦瓜第4号染色体21927644bp位置处，其多态性表现为碱基A是否缺失，所述分子标记所在的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示，所述分子标记于如SEQ ID NO.1所示中的167bp处。本申请可以在苗期或种子时期对苦瓜果实果皮形态进行预测，可以鉴定出目标性状遗传位点的纯合或杂合状况，从而可对后代果皮形态表型(连续脊或非连续脊)进行较准确的预测。
本发明公开了与甜瓜蔓枯病抗性基因Gsb‑3共分离的InDel分子标记及其应用。通过构建重组自交系分离群体，利用BSA方法结合全基因组重测序对甜瓜蔓枯病抗性进行基因定位，在两亲本之间具有多态性的位点设计开发InDel分子标记，并在分离群体各株系中对分子标记进行筛选验证，最终挖掘到了一个与甜瓜蔓枯病抗性基因Gsb‑3共分离的分子标记。该分子标记所包含的核苷酸序列分别由SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.2所示的引物经PCR扩增得到，扩增得到的片段分别与抗病和感病基因共分离。本发明提供的分子标记可以有效、快速的区分甜瓜蔓枯病抗、感单株，提高了甜瓜蔓枯病表型鉴定的准确性，可作为一种有效的手段应用于甜瓜蔓枯病抗病育种实践中。
