本发明涉及医药基因工程领域,特别涉及一种编码IER5基因的shRNA序列的DNA序列及其载体和应用。一种编码IER5基因的shRNA序列的DNA序列,以如SEQ ID NO.1所示的正义链和如SEQ ID NO.2所示的反义链设计得到;或以如SEQ ID NO.3所示的正义链和如SEQ ID NO.4所示的反义链设计得到。本发明提供的DNA序列,是在IER5基因全序列的基因编码区中寻找靶序列,利用在线siRNA设计软件,参考小干扰RNA设计原则,从众多序列中筛选得到的两对靶序列,由这两对靶序列设计的编码IER5基因的shRNA序列的DNA序列插入载体稳定,沉默IER5基因效果好。