本发明涉及双链特异性核酸酶，特别涉及双链特异性核酸酶变体及其应用。所述双链特异性核酸酶变体的氨基酸序列与SEQ ID NO:1相比，具有一个或多个氨基酸取代；所述氨基酸取代的位点选自第32位、第56位、第91位、第146位、第162位、第247位、第326位或其组合。本发明的双链特异性核酸酶变体与北极虾野生型DSN相比，活性更高；本发明的可溶表达的双链特异性核酸酶变体则解决了野生型DSN在原核表达系统中难以可溶表达的问题，进一步提高了DSN的可溶表达水平和活性；极大的推动了低成本、高效获取高活性DSN的工业化进程。
