本发明公开了一种基于抗生素标记的超嗜热泉古菌表达载体,包含一个原核复制起点、一个古菌复制起点、氨苄青霉素抗性基因、多克隆位点、阿拉伯糖启动子和抗生素选择标记基因simR;所述载体的核苷酸序列为SEQ ID NO.4所示序列。其中simR基因是一种辛伐他汀抗性基因,由sac7d基因的启动子和hmg基因组成。本发明还公开了所述表达载体在超嗜热泉古菌中表达超嗜热酶的应用。本发明的载体具有广泛的宿主范围,转化效率高,假阳性低,可以简便、快速、高效的表达带有组氨酸标签的超嗜热酶,预示本发明的载体具有很好的应用前景。