本发明公开了一种菜心恢复系分子标记及其应用，属于基因工程技术领域，所述分子标记为SEQ ID NO：14所示的核苷酸序列片段，共230bp。本发明通过菜心和油菜的序列比对，发现二者存在一些SNP和InDel，猜测这些SNP和InDel可能是菜心BraRfo基因无法恢复育性的原因，之后选取比对结果中一段较长的InDel，经PCR扩增验证，结果显示菜心自交系与菜心和油菜恢复系的扩增条带确实存在差异，从而准确鉴定油菜恢复基因转入菜心的恢复系材料，辅助菜心恢复系的高效和快速转育。
本发明公开了一种与辣椒青熟果色相关的分子标记，属于生物技术领域。所述分子标记的核苷酸序列如SEQ ID NO.55所示。扩增所述分子标记的引物包括如SEQ ID NO.35所示的上游引物和如SEQ ID NO.36所示的下游引物。本发明研究证实该分子标记InDel107的带型与辣椒青熟期果实颜色的表型联系最紧密，采用InDel107对辣椒植株进行鉴定，结果显示其准确率超过80.9％，因此能够将InDel107作为鉴定辣椒青熟期果实颜色性状的分子标记，为辣椒果实颜色的品种选育提供参考和理论基础。
本发明公开了一种与菜心多叶性状相关的分子标记及其应用，属于植物育种技术领域。所述分子标记的核苷酸序列如SEQ ID NO.14所示。扩增所述分子标记的引物对序列如SEQ ID NO.10‑11所示。本发明研究证实所述分子标记与植株表型紧密相关，采用所述分子标记对菜心多叶植株进行鉴定，准确率超过95％。通过所述分子标记对菜心材料进行鉴定，随后对不同品种进行杂交或改良，防止菜心出现多叶性状导致的开花结实率低，有利于创制新种质资源，易于收种和杂交，得到更优质的菜心品种。
本发明属于植物选育技术领域，具体涉及一种与芥蓝菇叶发生紧密连锁的InDel标记及其应用。该InDel标记包括序列如SEQ ID NO：1和SEQ ID NO：2所示的引物对。该InDel标记基于PCR扩增，扩增条带清晰，多态性高、分辨率高，可以准确鉴定芥蓝是否含有菇叶；而且简便易行，可操作性强，经济实用。
