本发明属于基因工程技术领域，具体涉及一种水稻Nus1基因缺失突变体nus1a及其分子标记和应用。本发明所述白穗突变体nus1a为Nus1基因的缺失突变，包括如SEQ ID NO.1所示的核苷酸序列。本发明SEQ ID NO.1所示的核苷酸序列全长717bp，所述水稻Nus1基因缺失突变体nus1a与正常品种Nus1基因的编码区核苷酸序列相比，缺失了从665位至675位核苷酸共11bp，导致编码提前终止，不能形成有正常功能的Nus1蛋白产物，使水稻表现为白穗。
本发明公开了一种调控稻米镉积累的基因OsABCG42及其编码蛋白和应用，基因OsABCG42的核苷酸序列如SEQ ID NO：1所示，编码蛋白的氨基酸序列如SEQ ID NO：2所示。本发明通过基因编辑、EMS诱变、辐射诱变、航天搭载等诱变技术，突变基因OsABCG42，改良现有水稻的镉积累特性。结合分子标记辅助选择，还可实现多基因聚合创制稻米镉含量低的水稻品种，操作简单，改良和培育新品种的周期短，且不影响主要农艺性状。
本发明公开了一种调控水稻雌性器官育性的基因及其编码蛋白和应用，其中调控水稻雌性器官育性的基因为OsMLH3基因；OsMLH3基因的序列为SEQ ID NO.3的核苷酸序列。由OsMLH3基因编码得到的蛋白氨基酸序列为SEQ ID NO.4的核苷酸序列。OsMLH3基因可应用于调控水稻雌性器官育性，培育出新的水稻雌性不育恢复系。
