本发明公开了一种纤维素酶及其编码基因与应用。该纤维素酶的氨基酸残基序列如(a)或(b)所示:(a)如SEQ ID No:1所示的氨基酸残基序列;(b)对如SEQ ID No:1所示的氨基酸残基序列经过1个或几个氨基酸残基的取代和/或缺失和/或添加且对植物角果开裂具有调控作用的氨基酸序列。本发明所述的纤维素酶基因被突变或被抑制表达后可显著推迟角果的开裂时间,同时降低植物角果的开裂率,从而减少由于环境因素导致相关作物角果提前开裂导致种子减产和造成土地污染的损失,进而保证作物种子的高产出,具有较高的实际应用价值,应用前景广阔。