本发明公开了一种鉴定青鱼遗传性别的分子标记及其应用，属于水产动物遗传育种领域。该分子标记包括核苷酸序列如SEQ ID NO：1所示的青鱼雌雄鱼共有条带和核苷酸序列如SEQ ID NO：2所示的青鱼雄鱼特有条带，鉴定方法包括：以待鉴定青鱼样品的DNA为模板进行PCR扩增，PCR产物经琼脂糖电泳确定有条带后进行毛细管电泳，若在152bp和168bp处同时出现信号时，则为雄性；若仅在168bp处出现信号时，则为雌性。本发明的分子标记能准确获得不同青鱼群体的遗传性别，具有简便、快捷、高效、不受早期青鱼性腺未分化的影响等优势，用于青鱼标记辅助育种大大节约养殖成本，提高育种效率。
本发明公开了一种与青鱼生长相关QTL紧密连锁的分子标记及其应用，其包括分子标记snp8107和snp9562，其中snp8107具有长度为437bp且核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示的靶序列，在第163位核苷酸存在一个A/G SNP位点；snp9562具有长度为274bp且核苷酸序列如SEQ ID NO:2所示的靶序列，在第172位核苷酸存在一个G/A SNP位点。本发明中筛选并鉴定出与青鱼生长相关QTL紧密连锁的分子标记，可以用于筛选具有优势基因型的青鱼个体，具有简便、高效、准确和特异性较高的优势，用于青鱼的标记辅助育种可以大大节约养殖成本，提高育种效率。
