本发明公开了鉴定大口黑鲈遗传性别的分子标记及应用,分子标记的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示。本发明从大口黑鲈中筛选获得了性别差异的DNA片段,将基因组序列为SEQ ID NO:1的SNP分子标记用于大口黑鲈遗传性别鉴定,并根据差异的片段设计检测引物,从而可以快速、准确的区分大口黑鲈的性别。利用本发明的SNP位点,在生产上可快速对大口黑鲈遗传进行鉴定,在大口黑鲈单性育种方面具有重要的应用价值,同时在定位性别决定基因及性别决定机制研究中也具有重要应用前景。与之前解剖检测或生殖孔观察相比,该技术具有目的性强、准确度高的优点,且操作简单、检测快速,对鱼体伤害少,易于推广。