本发明公开了一种表达胶原酶的大肠杆菌及其构建方法与应用。本发明一种蜡样芽孢杆菌Bacillus cereus R75E分泌的一种胶原酶的氨基酸序列(如SEQ ID NO:1所示)与核苷酸序列(如SEQ ID NO:2所示)。本发明提供含有上述胶原酶基因在大肠杆菌中的表达菌。本发明提供一种含有表达所述DNA分子的重组大肠杆菌,所述重组大肠杆菌是在宿主菌中导入所述的大肠杆菌重组表达载体得到的大肠杆菌菌株。本发明提供一种纯化所述重组胶原酶的方法及在降解鱼鳞中Ⅰ型胶原蛋白方面的应用。本发明的重组胶原酶,能够高效降解天然的Ⅰ型胶原蛋白纤维,效果显著,可应用于农副产品中胶原蛋白的开发利用、水产品胶原蛋白的加工与利用、医疗以及食品工业生产中胶原酶的应用。