本发明涉及一种鸡HS6ST3基因43bp indel多态性标记及其应用、检测引物、试剂盒，属于分子遗传学育种技术领域。本发明发现了HS6ST3基因第1内含子中存在一个43bp indel多态性标记，该43bp突变多态标记与鸡12周龄胫围、6周体重等多种经济性状显著相关，可用于鸡的辅助选择和分子育种。具体的：根据SEQ ID NO.1所示的序列设计扩增片段包含该序列5‘端起的第176‑218位的引物，根据扩增产物的大小判断第176‑218位是插入/缺失，通过加强对第176‑218位纯合缺失的优势基因型个体的选育来提高地方、商品鸡的经济效益，该方法无需酶切、易于分辨、判型准确、操作简单、成本低、周期短。
本发明涉及一种与鸡致死相关的SNP标记及其应用、检测引物、检测试剂盒，属于生物育种技术领域。本发明首次发现了与鸡致死相关的SNP标记，其序列如SEQ ID NO.1所示，其中第267位碱基发生T＞G突变，GG的纯合突变会使鸡早期胚胎致死，在鸡群体中该位点仅存在TT基因型或者TG基因型。本发明根据该SNP标记设计特定引物，用以扩增包含该位点在内的目的片段，能够检测出鸡个体的致死突变基因型，淘汰TG基因型的杂合鸡个体，可快速纯合非致死的等位基因，能够提高鸡群的繁殖性能。
本发明涉及一种与鸡屠体性状相关的SNP标记及其应用、检测引物、检测试剂盒，属于生物育种技术领域。本发明首次发现如SEQ ID NO.1所示序列5’端起427位的GA突变位点，该的SNP位点对应于NCBI公布的鸡参考基因组Gallus_gallus‑5.0版本序列信息十六号染色体正义链第350006位脱氧核苷酸。该SNP标记中AA纯合型鸡个体的生长后期体重和产肉性能极显著高于GG和GA基因型个体，可用于鸡屠体性状的选育，能够在早期对于鸡的屠体性状进行选择，加快鸡的育种过程，节省生产成本。
