本发明公开了稻瘟菌MoCHS1基因及其编码蛋白的功能与用途,该基因控制稻瘟菌的分生孢子形态、产胞量、附着胞形成率与致病力,该基因及其cDNA和编码的蛋白质分别具有序列表中SEQ ID №:1、№:2和№:3的核苷酸或氨基酸序列。MoCHS1基因的敲除导致稻瘟菌分生孢子的形态建成发生改变,分生孢子变小,没有隔膜或者只有一个隔膜,分生孢子产量下降到野生型菌株的2%,附着胞形成率降低为野生型菌株的60%,对水稻叶片的侵染能力显著下降。MoCHS1编码的蛋白或/和其在其它病原真菌中的同源蛋白的表达或修饰均可作为重要候选靶标,用于设计和筛选抗真菌的新型药剂。