本发明公开了一种用于功能标记检测水稻香味基因badh2的引物及试剂盒和方法，四引物PCR扩增体系中，引物对的核苷酸序列如SEQ ID NO.3、SEQ ID NO.4、SEQ ID NO.7、SEQ ID NO.8所示；所述badh2基因为水稻香味基因；所述Badh2基因为水稻非香基因。本发明针对badh2基因第七外显子突变类型的检测标记还存在操作复杂、成本高的缺点，为了能更快的、更有效的将香味基因badh2应用到水稻品质育种项目中，本发明提供了一种香味基因badh2的功能标记的开发方法，利用该方法设计的功能标记能提高badh2基因在分子标记辅助选择育种的准确性及降低检测费用。
本发明公开了一种利用功能标记检测Xa23基因的引物组及试剂盒和方法，针对的Xa23基因具有如SEQ ID No.1所示的核苷酸序列，水稻品种IR24的Xa23感病等位基因xa23具有如SEQ ID No.2的所示的核苷酸序列，利用功能标记检测Xa23基因的引物组具有如SEQ ID No.3‑6所示的核苷酸序列。Xa23基因是当前发现的抗性最强、抗谱最广的显性抗白叶枯病基因，通过本发明的方法能够更快的、更有效的将白叶枯病抗性基因Xa23应用到广谱、持久抗性育种项目中，提高Xa23基因在分子标记辅助选择育种、基因聚合育种以及转基因育种中的利用效率。
