本发明公开了一种来源于伯克霍尔德氏菌的LysR家族转录调控蛋白、基因及应用。本发明经筛选得到了一个新的LysR家族转录调控基因BysR的框内缺失突变株,该突变株表现出明显降低的抑制纹枯病菌的活性,且JP2‑270发酵代谢物中吡咯菌素的合成也受到阻断,经进一步研究发现了一种调控吡咯菌素合成的LysR家族转录调控基因,所述LysR家族转录调控蛋白为BysR蛋白,氨基酸序列如SEQ ID No.2所示,对应基因命名为bysR基因,基因序列如SEQ ID No.1所示。本申请为进一步提高吡咯菌素的生物合成量提供遗传基础。