本发明公开了一种基于自适应差分鲸鱼优化的微电网HESS优化配置方法及系统,本发明方法包括考虑公用电网停电情况为微电网的负荷选择负荷用电模式;根据负荷用电模式建立以综合投资成本最低为目标的混合储能系统(Hybrid Energy Storage System,HESS)优化配置函数;利用自适应差分鲸鱼优化算法对HESS优化配置函数寻优得到最优HESS配置方案。本发明旨在解决指导有新能源并入的微电网优化配置HESS,在减小微电网波动的同时降低储能配置的综合成本,通过优化配置HESS,在保证HESS及微电网可靠运行的同时,可提高HESS的经济性和使用寿命。