一种鉴定微生物多肽的方法，其中多肽与受微生物处理的动物的免疫反应有关，该方法包括如下几个步骤：(1)提供众多不同突变体微生物；(2)使这些众多突变体微生物与对微生物或其部分产生免疫反应的动物的抗体接触，其条件是如果抗体结合突变体微生物，突变体微生物被杀伤；(3)从步骤(2)选择存活的突变体微生物；(4)鉴定在存活突变体微生物中含有突变的基因；以及(5)鉴定该基因编码的多肽。所鉴定的多肽或其变异体或片段或这些结构的融合体在疫苗中是有用的。多肽可以为由选自序列号SEQ ID Nos 2、4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、40、42、44、46、48、50、52、54、56的任一序列的氨基酸序列组成的多肽，或其片段或变异体或此片段或变异体的融合体，用于抗奈瑟氏脑膜炎球菌疫苗。
