[发明专利]一种构建测序文库的方法及应用在审

专利信息
申请号: 202310444110.6 申请日: 2023-04-23
公开(公告)号: CN116555922A 公开(公告)日: 2023-08-08
发明(设计)人: 姜锋;李贝贝;张介中;李志民;王娟 申请(专利权)人: 安诺优达基因科技(北京)有限公司
主分类号: C40B50/06 分类号: C40B50/06;C12Q1/6806;C12Q1/6869
代理公司: 暂无信息 代理人: 暂无信息
地址: 100176 北京市大兴区经济技*** 国省代码: 北京;11
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摘要:
搜索关键词: 一种 构建 序文 方法 应用
【说明书】:

发明涉及一种构建测序文库的方法及应用。该构建测序文库的方法包括:S1、将核酸样本进行末端修复和加腺苷酸尾,得到加腺苷酸尾产物;S2、将所述加腺苷酸尾产物与接头进行连接,得到接头连接产物;其中,末端修复和加腺苷酸尾为连续进行的;其中,将所述加腺苷酸尾产物与接头进行连接为连续进行的;其中,将所述加腺苷酸尾产物与接头进行连接采用第二缓冲溶液,所述第二缓冲溶液不包括二价阳离子,且采用低分子量PEG。采用本发明的构建文库方法,能够实现一管到底的操作,全程反应均在一个体系中进行,只需加入下一步的反应液,不需纯化,仅PCR后一步纯化完成建库。大大简化了操作流程,而且还能提高文库产量。

技术领域

本发明涉及一种缓冲液组合物、包括该缓冲液组合物的试剂盒及应用。

背景技术

在二代测序中,待检测的待测序列分子,需要通过文库构建,为未知待测序列,添加上已知序列的测序接头;而在文库构建过程中,常存在待检测序列分子样本量不足的情况,如cfDNA检测、口腔拭子、干血斑、穿刺样本等痕量DNA检测需求,为满足后续文库质控、上机测序需求,必须进行PCR扩增,以放大测序模板量。

但是,在二代测序文库构建测序接头连接步骤,除了在目的片段两端各连接上一个测序接头的目标产物外,不可避免的会出现无插入目的片段的两个测序接头自连副产物,且该种接头自连副产物的产量(摩尔量)远高于正常目的片段连接的目标产物量(摩尔量),现有的连接试剂,在推荐接头底物配比的反应体系下,副产物摩尔量大多为目标产物摩尔量的5-10倍。

通常,接头自连产物通常通过后续连接反应后磁珠纯化去除,但实际应用中,该步骤磁珠纯化对于接头自连产物去除效率不足,会残留较多接头自连产物进入后续PCR反应体系,接头自连副产物在整个连接产物中占比过高,即使经过纯化后部分去除,仍然会有较大量的副产物残留。

而且,现有的建库流程中,在末端修复和加腺苷酸尾之间需要纯化,在加腺苷酸尾产物与接头进行连接之间也需要纯化,增加了操作流程、建库时间和成本。目前虽然有对纯化过程进行优选的技术,例如CN113512766A公开了一种DNA二代测序文库的构建方法,以双酶切和末端修复一步反应工艺,第一步反应结束无需进行磁珠纯化,使得构建工艺简单,但是其在PCR扩增之前还是需要进行纯化。

发明内容

为了解决上述问题,本发明提供了一种构建测序文库的方法,采用本发明的构建文库方法,能够实现一管到底的操作,在完成PCR扩增之前无需进行纯化,大大简化了操作流程,方便操作,而且还能显著降低接头二聚体副产物的产生,提高文库产量。

具体来说,本发明涉及如下构建测序文库的方法及应用。

1.一种构建测序文库的方法,包括:

S1、将核酸样本进行末端修复和加腺苷酸尾,得到加腺苷酸尾产物;

S2、将所述加腺苷酸尾产物与接头进行连接,得到接头连接产物;

其中,末端修复和加腺苷酸尾为连续进行的;

其中,将所述加腺苷酸尾产物与接头进行连接为连续进行的;

其中,将所述加腺苷酸尾产物与接头进行连接采用第二缓冲溶液,所述第二缓冲溶液不包括二价阳离子,且采用低分子量PEG。

2.根据上述的方法,其中,在S2之后,所述方法还包括:S3、将所述接头连接产物进行PCR扩增;

优选地,将所述接头连接产物进行PCR扩增为连续进行的;

优选地,在PCR扩增完成前,无需进行纯化。

3.根据上述的方法,其中,在S1之前,所述方法还包括将核酸样本进行片段化处理,得到片段化DNA。

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