[发明专利]一种构建测序文库的方法及应用在审
申请号: | 202310444110.6 | 申请日: | 2023-04-23 |
公开(公告)号: | CN116555922A | 公开(公告)日: | 2023-08-08 |
发明(设计)人: | 姜锋;李贝贝;张介中;李志民;王娟 | 申请(专利权)人: | 安诺优达基因科技(北京)有限公司 |
主分类号: | C40B50/06 | 分类号: | C40B50/06;C12Q1/6806;C12Q1/6869 |
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地址: | 100176 北京市大兴区经济技*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 构建 序文 方法 应用 | ||
1.一种构建测序文库的方法,包括:
S1、将核酸样本进行末端修复和加腺苷酸尾,得到加腺苷酸尾产物;
S2、将所述加腺苷酸尾产物与接头进行连接,得到接头连接产物;
其中,末端修复和加腺苷酸尾为连续进行的;
其中,将所述加腺苷酸尾产物与接头进行连接为连续进行的;
其中,将所述加腺苷酸尾产物与接头进行连接采用第二缓冲溶液,所述第二缓冲溶液不包括二价阳离子,且采用低分子量PEG。
2.根据权利要求1所述的方法,其中,在S2之后,所述方法还包括:S3、将所述接头连接产物进行PCR扩增;
优选地,将所述接头连接产物进行PCR扩增为连续进行的;
优选地,在PCR扩增完成前,无需进行纯化。
3.根据权利要求1或2所述的方法,其中,在S1之前,所述方法还包括将核酸样本进行片段化处理,得到片段化DNA。
4.根据权利要求1-3中任一项所述的方法,其中,所述第二缓冲液包括:Tris缓冲液、二硫苏糖醇和低分子量PEG,且所述第二缓冲液不包括二价阳离子;
更优选地,所述第二缓冲液包括:60-70mM的Tris缓冲液、1-4mM的二硫苏糖醇、15体积%-40体积%的低分子量PEG,pH为7-9。
5.根据权利要求1-4中任一项所述的方法,其中,将核酸样本进行末端修复和加腺苷酸尾处理采用第一缓冲溶液;
优选地,所述第一缓冲溶液包括:Tris缓冲液、二价阳离子、一价阳离子、ATP和dNTP;
更优选地,所述第一缓冲液包括:40-75mM的Tris缓冲液、20-100mM的二价阳离子、200-1000mM的一价阳离子、5-25mM的ATP和2.5-25mM的dNTP,pH为7-10;
更进一步优选地,所述第一缓冲液还包括表面活性剂;优选地,以第一缓冲液的总重量为基准,所述表面活性剂的含量为0.01-2质量%;更优选地,所述表面活性剂选自聚乙二醇辛基苯基醚、Tween20、Tween40和Tween60中的至少一种。
6.根据权利要求4或5所述的方法,其中,所述Tris缓冲液为Tris-盐酸缓冲液和/或Tris-醋酸缓冲液;和/或,
所述二价阳离子选自Mg2+、Mn2+和Ca2+中的至少一种;和/或,
所述低分子量PEG的分子量为200-1000,更优选地,所述低分子量PEG选自PEG200、PEG400、PEG600、PEG800和PEG1000中的至少一种。
7.根据权利要求1-6中任一项所述的方法,其中,将核酸样本进行末端修复和加腺苷酸尾的步骤还采用第一酶;
优选地,所述第一酶为DNA聚合酶和加腺苷酸尾酶;
优选地,所述DNA聚合酶为TaqDNA聚合酶和/或T4DNA聚合酶;
优选地,所述加腺苷酸尾酶选自klenow(3’-5’exo-)、klenowfragement和T4PolynucleotideKinase中至少一种;
优选地,所述DNA聚合酶的用量为0.2-0.6U/μL;
优选地,所述加腺苷酸尾酶的用量为0.2-0.5U/μL。
8.根据权利要求1-7中任一项所述的方法,其中,将所述加腺苷酸尾产物与接头进行连接的步骤还采用第二酶;
优选地,所述第二酶为T4DNAligase;
优选地,所述第二酶的用量为100-300U/μL。
9.根据权利要求1-8中任一项所述的方法,其中,末端修复和加腺苷酸尾的反应条件包括:16-40℃下5-30分钟和65-75℃下10-30分钟;和/或,
将所述加腺苷酸尾产物与接头进行连接的反应条件包括:15-25℃下20-40分钟;和/或,
所述接头的浓度为0.1-50μmol/L。
10.权利要求1-9中任一项所述的构建测序文库的方法在生物技术,尤其在基因测序中的应用。
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