[发明专利]用于结核分枝杆菌耐药基因检测的引物组、产品及应用

说明书

本申请涉及生物技术领域，具体提供一种检测结核分枝杆菌耐药基因突变的引物、产品及应用，本申请能够在核酸质谱平台中同时完成多种治疗结核药物相关16基因53SNP位点的准确检测。

技术领域

本申请涉及生物技术领域，尤其是涉及一种用于结核分枝杆菌耐药基因突变检测相关的引物、产品及应用。

背景技术

WHO将耐药结核病分为五类：耐异烟肼结核病、利福平耐药结核病和耐多药结核病，以及准广泛耐药结核病和广泛耐药结核病。

结核病患者一旦出现耐药，预后极差，成为结核病控制工作中亟待解决的难题。WHO于2018年12月出版发行了“MDR-TB和RR-TB治疗指南(2018更新版)”，2019年3月又发布了“耐药结核病治疗指南(2019整合版)”，WHO同时指出，这2个指南是在评估大量最新证据的基础上制定的，将取代之前所有的WHO关于耐药结核病的治疗指南。为更好地推广和使用WHO“MDR-TB和RR-TB治疗指南(2018更新版)”和“耐药结核病治疗指南(2019整合版)”，中华医学会结核病学分会制定了“中国MDR-TB和RR-TB治疗专家共识(2019年版)”。该共识在化学治疗中明确说明在治疗前需进行表型药敏试验(drugsusceptibility testing，DST)，包括一线及二线抗结核药物，有条件时应同时采用快速分子药敏检测。并且将长程MDR-TB治疗方案中使用的抗结核药物重新划分为3组：A组：首选药物，包括左氧氟沙星(levofloxacin，Lfx)或莫西沙星(moxifloxacin，Mfx)、贝达喹啉(bedaquilin，Bdq)和利奈唑胺(linezolid，Lzd)。B组：次选药物，包括氯法齐明(clofazinmine，Cfz)、环丝氨酸(cycloserine，Cs)。C组：备选药物，依次为吡嗪酰胺(pyrazinamide，Z)、乙胺丁醇(ethambutol，E)、德拉马尼(delamanid，Dlm)、丙硫异烟胺(protionamid，Pto)、阿米卡星(amikacin，Am)或卷曲霉素(capreomycin，Cm)、对氨基水杨酸(p-aminosalicylic acid，PAS)、亚胺培南/西司他丁(imipenem/cilastatin，Ipm-Cln)或美罗培南(meropenem，Mpm)。该共识明确了左氧氟沙星(levofloxacin，Lfx)或莫西沙星(moxifloxacin，Mfx)、贝达喹啉(bedaquilin，Bdq)和利奈唑胺(linezolid，Lzd)及氯法齐明(clofazinmine，Cfz)等在治疗MDR-TB中的重要地位。目前已有报道出现了这些药物的耐药性，随着这些药物的应用，其耐药性的检测也是迫在眉睫，而目前上市的结核分枝杆菌耐药基因突变检测的产品主要针对利福平与异烟肼耐药，贝达喹啉(bedaquilin，Bdq)和利奈唑胺(linezolid，Lzd)及氯法齐明(clofazinmine，Cfz)等的耐药检测产品目前市场上较少出现；而且目前市场上耐药结核基因突变检测产品的适用样本类型单一，约80％为培养物样本，这样无疑增加了患者等待时间。所以，综合考虑目前市场需求及未来耐药结核患者化学治疗的用药趋势，建立有效、快速、适用样本类型丰富的耐药结核病检测方法是临床合理用药和控制疫情发展的关键。

有鉴于此，提出本申请。

发明内容

本申请的第一个目的在于提供一种用于结核分枝杆菌耐药基因突变检测的特异引物组。

本申请的第二个目的在于提供上述的用于检测结核分枝杆菌耐药基因突变的引物组在制备结核分枝杆菌耐药基因检测产品中的应用。

本申请的第三个目的在于提供一种用于结核分枝杆菌耐药基因突变检测的产品，以补充现有技术中缺少的能够高通量、易操作且低成本的针对结核分枝杆菌耐药基因突变进行检测的产品的技术问题。

本申请的第四个目的在于提供一种检测结核分枝杆菌耐药基因突变的方法，以缓解现有的检测方法通量低、适用样本类型单一、适用抗结核药物较少、价格昂贵等技术问题。

为实现上述目的，本申请具体提供如下技术方案：